陆地棉背景达尔文氏棉A亚组染色体片段导入系农艺性状QTL定位

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棉花是世界上重要的天然纤维作物,广泛种植于世界各地。陆地棉产量高、适应性广,生产了世界上95%的原棉,现有陆地棉品种大多纤维偏粗。异源四倍体野生种达尔文氏棉有耐盐碱、耐贫瘠、耐旱、纤维细度好等优点。构建陆地棉遗传背景的达尔文氏棉染色体片段导入系可以挖掘达尔文氏棉基因组中的产量和纤维品质有利基因,拓宽陆地棉遗传背景,培育综合性状优良的陆地棉栽培种。本研究利用陆地棉丰产品种中35作为轮回亲本,达尔文氏棉5-7为供体亲本构建BC3F2染色体片段导入系。利用实验室前期构建的陆地棉和达尔文氏棉种间遗传连锁图谱上均匀分布的SSR标记,对群体内的553个BC3F2染色体片段代换单株进行标记基因型检测。以BC3F2单株和BC3F2:3家系的产量和纤维品质数据进行QTL定位,主要结果如下:1.达尔文氏棉染色体片段导入系构建及基因型检测本研究挑选均匀分布于陆地棉和达尔文氏棉种间遗传连锁图谱的190个SSR标记,检测553个BC3F2群体单株的基因型,发现有3株没有导入达尔文氏棉片段,因此构建了包含550个单株的染色体片段导入系群体。2.A亚组染色体片段导入系各单株导入片段550个单株的平均遗传背景恢复率为91.8%,最大遗传背景恢复率高达99.8%,最小值仅为72%;导入达尔文氏棉片段长度在4.09-568.23cM之间,渗入率在0.2-27.8%之间,平均导入片段长度为163.41cM,占检测长度的8.00%;其中导入达尔文氏棉纯合片段的平均长度为39.61cM,平均渗入率为1.94%,导入长度最大为212.576cM,最小片段长度为0cM,导入片段的渗入率为0-10.4%;导入杂合片段平均长度为123.80cM,平均导入率为6.01%,导入杂合片段的长度最大为523.62cM,最小值为0cM,杂合片段导入率在0-25.6%之间。导入片段数目在1-35个之间。3.A亚组染色体片段导入系各条染色体导入片段达尔文氏棉导入系A亚组13条染色体平均遗传背景恢复率为92.09%,第11条染色体的遗传背景恢复率最高,达95.31%,第9条染色体的恢复率最低为88.07%;总导入片段平均长度、导入纯合片段平均长度和导入杂合片段平均长度最长分别是第5染色体、第1染色体和第5染色体,分别为19.26cM、4.66 cM和14.63cM,总导入片段平均长度、导入纯合片段平均长度和导入杂合片段平均长度最短均为第4染色体,分别为5.13cM、0.79cM和4.24cM。4.棉花产量和纤维品质QTL定位本研究共检测到65个产量和纤维品质性状QTL。其中有9个QTL(qLP1.3、qLP2.1、qLP5.1、qLP5.2、qLP7.1、qLP9.1、qLP9.2、qLP13.1、qFS12.1)在两个环境中均检测到。产量性状QTL 39个,解释表型变异1.7-4.8%。其中,籽指QTL有7个,解释表型变异1.9-3.5%;铃重QTL有12个,解释表型变异1.7-4.7%;衣分QTL有20个,解释表型变异1.8-4.8%;纤维品质QTL有26个,解释表型变异1.9-6.7%。其中,纤维长度QTL有4个,解释表型变异2.3-6.4%;整齐度QTL有4个,解释表型变异2-4.3%;纤维强度QTL有4个,解释表型变异2.1-5.4%;马克隆值QTL有6个,解释表型变异2.3-5.8%;纤维伸长率QTL有8个,解释表型变异2.2-6.7%;25个QTL的有利等位基因来源于达尔文氏棉,40个QTL的有利等位基因来源于中棉所35。
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