水稻粒形、粒重、柱头外露和糙米蛋白含量的QTL定位及效应验证

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水稻的粒形(可分解为粒长、粒宽和粒厚)对水稻的千粒重和外观品质有着十分重要的影响,千粒重是决定水稻产量的一个重要因素,而外观品质决定了稻米的商业价值。随着生活品质的提高,人们也越来越重视稻米的营养品质,而水稻糙米蛋白质的含量与稻米品质紧密相关。水稻的柱头外露率则是影响水稻异交结实率的重要因子,进而影响杂交水稻的制种产量,制约着杂交水稻商业化进程。本研究运用高通量测序技术,利用构建的两个重组自交系群体,对控制水稻粒形、千粒重、糙米蛋白含量、柱头外露率、抽穗期、株高和糙米率相关的数量性状位点(quantitative trait loci,QTL)进行定位和验证。1、采用安徽省农业科学院水稻研究所从扬稻6号中选育而来的大粒籼稻品种扬稻6号选(YD6-X)和籼型光温敏核不育系1892S杂交,多代自交,构建了共包含136个家系的重组自交系群体(RILs)。利用基于测序的基因分型技术(GBS)开发的SNP标记和INDEL标记绘制了该RILs群体的分子标记遗传连锁图谱。遗传图谱的标记总数43175个,bin总数1563个,总长度1455.64c M,标记之间的平均距离0.03c M。利用SNP/INDEL标记在F6(2016年)和F7(2017年)中共检测到8个粒长相关的QTL,分布于第1、2、4、6、7、8染色体上,其中有2个QTL在两年被重复检测到;7个粒宽相关的QTL,分布于第2、4、7、9、11染色体上,其中有2个QTL在两年被重复检测到;8个粒厚相关的QTL,分布于第1、2、4、7、9染色体上,其中有3个QTL在两年被重复检测到;10个千粒重相关的QTL,分布于第1、2、4、7、9染色体上,其中有2个QTL在两年被重复检测到;4个抽穗期相关的QTL,分布于第5、7、12染色体上,其中有1个QTL在两年被重复检测到;7个柱头单外露率相关的QTL,分布于第1、2、4、5、7、8染色体上,其中有1个QTL在两年被重复检测到;4个柱头双外露率相关的QTL,分布于第1、3、4、7染色体上,其中有2个QTL在两年被重复检测到;5个柱头总外露率相关的QTL,分布于第1、2、3、4、7染色体上,其中有1个QTL在两年被重复检测到;3个糙米蛋白含量相关的QTL,分布于第2、7、9染色体上;5个株高相关的QTL,分布于第2、3、6、7、9染色体上;2个糙米率相关的QTL,分布于第2、9染色体上。2、采用安徽省农业科学院水稻研究所选育的小粒籼稻品种RH003和籼型光温敏核不育系1892S杂交,多代自交,构建了共包含190个家系的重组自交系群体(RILs)。利用GBS技术开发的SNP标记和INDEL标记绘制了该RILs群体的分子标记遗传连锁图谱。遗传图谱的标记总数39379个,bin总数1550个,总长度1247.48c M,标记之间的平均距离0.03c M。利用SNP/INDEL标记在F6(2016年)和F7(2017年)中共检测到8个粒长相关的QTL,分布于第1、2、3、6、9、11、12染色体上,其中有1个QTL在两年被重复检测到;8个粒宽相关的QTL,分布于第2、3、4、6、7、10、12染色体上,其中有4个QTL在两年被重复检测到;10个粒厚相关的QTL,分布于第1、2、3、7、11、12染色体上,其中有3个QTL在两年被重复检测到;7个千粒重相关的QTL,分布于第1、2、3、7染色体上,其中有3个QTL在两年被重复检测到;5个抽穗期相关的QTL,分布于第6、7、8、11染色体上,其中有2个QTL在两年被重复检测到;6个糙米蛋白含量相关的QTL,分布于第2、6、7、8、9、12染色体上;1个糙米率相关的QTL,分布于第7染色体上;7个株高相关的QTL,分布于第2、6、7、8、9染色体上。3、利用重组自交系群体,筛选并构建了13个初定位的QTL位点的剩余杂合系群体,进行效应验证。其中,1892S/YD6-X群体中的q TGW2.1位点在粒长和粒宽方向上验证到效应;1892S/RH003群体中q TGW1.1在粒长方向上验证到效应,q GW4.2在粒长和粒宽方向上验证到效应。
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