本研究以中国农业微生物菌种保藏管理中心收集保藏的59个金针菇菌株为实验材料，通过出菇实验，依据各菌株的生长特性、农艺性状以及生物学效率，从中筛选出4个供栽培的优良菌株。同时，采用形态学分类法、RAPD技术、ISSR技术以及IGS1，IGS2-RFLP技术，对金针菇种质资源进行遗传鉴定和遗传多样性评价。实验结论如下：1根据金针菇菌株的菌丝生长速度快慢、出菇期长短、生物学效率以及菌株商品性状的好坏等方面综合考虑，筛选出四个供栽培的金针菇优良菌株，分别为：ACCC51540、ACCC51062、ACCC50650、ACCC50862。2结合供试菌株栽培性状以及RAPD和ISSR聚类分析结果，供试的金针菇菌株存在丰富的遗传多样性。在0.28的分类水平上，RPAD和ISSR方法分别将供试菌株分为12个和15个类别。RAPD和ISSR聚类分析结果与形态学的划分结果基本一致，而ISSR聚类分析的分辨力比RAPD的分辨力强。3 RAPD试验结果显示：在筛选出的随机引物中，有多个多态性位点可以用来鉴别供试菌株。4在供试菌株中，黄色菌株之间有丰富的遗传多样性，而白色菌株之间的遗传变异不是很大。在形态学上，依据菌盖色泽的表现型，金针菇菌株可以分为黄、白两大类，但RAPD和ISSR聚类分析的试验结果表明：黄色菌株与白色菌株并不是完全分成两大类，黄色菌株与白色菌株有着内在的联系，它们之间的遗传变异可能不是很大。5本研究中，供试的金针菇菌株的IGS1区域表现出较高的保守性，扩增片段长度均在1.7Kb左右；IGS2的电泳图谱和IGS2的限制型内切酶的酶切图谱显示出多态性：如增加内切酶种类，有可能获得具有更丰富多态性的限制性内切酶酶切图谱。6传统的形态学分类法和现代的分子生物学分类法，两者的关系是相辅相成，互为验证。