周丛藻类是新疆伊犁河与额尔齐斯河特有土著鱼类重要的基础饵料资源,研究其种群结构及水质评价,对于保护该地区渔业资源与生态环境尤为重要。有鉴于此,2013年和2015年对伊犁河与额尔齐斯河的周丛藻类进行物种组成、优势种、密度、生物量和多样性指数等研究,并对两条河流人工基质和自然基质周丛藻类群落结构进行了比较,同时基于4种水质评价方法对两条河流的健康状况进行了水质评价,对额尔齐斯河不同物种的生态化学计量学进行了比较分析。主要研究结果如下:1.伊犁河周丛藻类隶属5门41属145种,其中硅藻门种类数最多,为113种(77.9%),其次是蓝藻门14种(9.7%),绿藻门13种(9.0%),裸藻门4种(2.8%),黄藻门1种(0.7%)。优势种主要为硅藻门的嗜盐舟形藻、偏肿桥弯藻、普通等片藻以及蓝藻门的皮状席藻等。额尔齐斯河周丛藻类隶属6门41属102种,其中硅藻门种类数最多,为67种(65.7%),其次是绿藻门20种(19.6%),蓝藻门6种(5.9%),裸藻门6种(5.9%),隐藻门2种(2.0%),黄藻门1种(1.0%)。优势种主要为硅藻门的小环藻、窄异极藻、偏肿桥弯藻、系带舟形藻以及蓝藻门的皮状席藻等。2.2013年伊犁河周丛藻类年平均密度为1331.7×106 ind/m2,年平均生物量为1908.5 mg/m2,整体上周丛藻类的密度与生物量表现为:平水期>丰水期>枯水期:干流>支流。2015年额尔齐斯河周丛藻类年平均密度为1572.0×106 ind/m2,年平均生物量为2785.3 mg/m2,整体上周丛藻类的密度与生物量表现为:丰水期>平水期>枯水期;干流>支流。通过比较发现自然基质和人工基质上周丛藻类的群落结构和优势种组成相似,两种不同基质上的周丛藻类都是硅藻占优势。两种基质周丛藻类的密度与生物量均差异明显(p<0.05),人工基质周丛藻类的平均密度和生物量分别为1351.3 ind/m2与2069.6 mg/m2,而自然基质周丛藻类的平均密度和生物量分别为2199.9 ind/m2与3228.9 mg/m2。3.伊犁河周丛藻类Shannon-Wiener多样性指数(H′)、Simpson多样性指数(D)、Pielou均匀度指数(J)和Margalef丰富度指数(d)的平均值分别为3.24、0.73、0.60和3.91;额尔齐斯河周丛藻类Shannon-Wiener多样性指数(H′)、Simpson多样性指数(D)、Pielou均匀度指数(J)和Margalef丰富度指数(d)的平均值分别为3.52、0.73、0.64和3.30。伊犁河周丛藻的密度与流速呈极显著的负相关(p<0.01),而与水温、盐度呈显著的正相关(p<0.05);生物量与流速呈极显著的负相关(p<0.01),而与水温呈显著的正相关(p<0.05)。额尔齐斯河周丛藻的密度与溶解氧呈极显著的正相关(p<0.01),而生物量与电导率、盐度、TDS呈显著的正相关(p<0.05)。4.基于生物多样性指数(Shannon-Wiener、Margalef、Pielou)、指示生物法、硅藻耐受性指数与藻类污染指数对伊犁河与额尔齐斯河进行水质评价,4种方法得到的水质评价结果不完全相同,但整体上水质评价结果基本一致:伊犁河除昭苏解放大桥、雅玛渡和伊犁河大桥水质相对较差外,其余采样点水质均处于较好状态,且整体上伊犁河流域水质良好;额尔齐斯河除冲乎尔大桥、托洪台水库、别列则克水质相对较差外,其余采样点水质均处于较好状态,且整体上额尔齐斯河流域水质较好。5.对新疆额尔齐斯河底栖动物、鱼类肌肉、周丛藻类滤膜和水生植物的C、N、P含量进行研究,发现底栖动物C、N、P含量变化范围分别为39.9%-52.7%、8.5%-9.5%及0.6%-0.7%;鱼类肌肉C、N、P含量变化范围分别为40.2%-48.3%、10.7%-13.0%及0.8%-1.4%;周丛藻类滤膜C、N含量变化范围分别为1.3%-2.0%和0.2%-0.3%;水生植物C、N、P含量变化范围分别为33.5%-39.6%、1.9%-2.1%及0.1%-0.2%。底栖动物N/P百分比7月份最低,而P含量与N/P比值呈显著的负相关,说明底栖动物N/P比变化主要是由P含量变化决定的,表明底栖动物在7月份的生长速率较快;鱼类肌肉N/P百分比5月份最低,而N含量与N/P比呈显著正相关,P含量与N/P比呈显著负相关,表明鱼类在5月份生长速率最快且体内具有选择性富集磷而排出多余氮的机制;水生植物N/P百分比5月份最低,同时C含量与N/P比呈极显著的正相关,推测水生植物在5月份的时候生长速率最快。