C市是我国重要的商品粮和经济作物基地。近年来,国家为促进粮食加工行业的健康发展,先后出台了一系列税收优惠政策。这些政策的实施切实促进了当地粮食加工企业的快速发展,但与此同时,粮食加工企业的税收负担也呈现快速下降趋势,许多企业出现大量留抵税额并且常年亏损,造成税负偏低等现象。本研究选取具有代表性的C市作为研究对象,采用实地调查、访谈等方法,并查阅大量统计文献资料,重点对粮食加工企业的税负进行研究以判断粮食加工企业的真实税负情况。通过调查分析C市粮食加工行业生产经营以及税负的真实现状,得出C市粮食加工行业实际税负水平的真实情况及其存在的问题,进一步从税收政策、税收管理两方面剖析了该问题及其出现的原因。在税收政策方面,国家给予粮食加工企业较多的税收优惠政策;现行增值税法规关于进、销项计提政策的不合理规定；纳税人自行开具农产品收购发票；实行消费性增值税,新增固定资产允许抵扣进项税；同时从事农产品初加工所得免征企业所得税等,以上诸多税收政策因素导致了粮食加工行业出现税负水平不合理的现象。在税收管理方面,基层单位税收管理力量薄弱,难以做到对粮食加工企业监管到位以及粮食加工企业诸如季节性强、物耗水平难以把握以及产品销售无法控制等自身的特点,加重了税务部门管理的难度,这些税收管理上出现的问题也势必会加重粮食加工行业出现税负水平不合理即无税或税负偏低的现象。通过以上分析和研究,本文提出了从调整粮食加工企业税收政策；运用信息化手段,加强粮食收购发票管理以及创新税务工作方式,加大日常管理和稽查力度三方面促进粮食加工企业税负水平合理化的建议,从而有助于形成更为完备、科学的税制,防范和降低涉税风险和税收执法风险,提高纳税人自觉依法纳税的遵从度,创造和谐的粮食加工行业税收执法环境和纳税环境。