来源于人的硫脂酶超家族成员2以及晶状体蛋白Mu crystallin的晶体结构以及生物学功能研究

来源 :中国科学技术大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:genersoft
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
人源硫酯酶超家族成员2(hTHEM2)在我们研究之前只是一个假想蛋白,对于其功能和结构一无所知。我们在结构基因组的项目支持下,首次克隆了该基因,并且在大肠杆菌中过量的表达,纯化,结晶该蛋白,并且利用Se-SAD法成功的解析了该蛋白2.3埃的晶体结构。晶体结构解析出之后,我们根据其结构与国外合作进行了其酶底物的筛选。为了了解其细胞内的功能,我们制备了该蛋白的单克隆抗体,同时也利用RT-PCR的方法检查了该蛋白在小鼠12种组织中的组织表达特异性,利用绿色荧光融合蛋白和免疫荧光的方法在两种癌细胞系中进行了其细胞内的定位,利用基于载体的siRNA敲减技术在HCT116细胞系中成功的对该基因进行了敲减。 人源硫酯酶超家族成员2的晶体结构显示该蛋白属于‘热狗’折叠模式,即六个β折叠片包裹着一个长的α螺旋。通过DALI搜索,我们发现该蛋白结构和来源于大肠杆菌的苯乙酸降解途径中的PaaI的结构非常相似,底物筛选的结果显示出与大肠杆菌PAAI具有相同的底物特异性:都可以水解苯环氧化的苯乙酸辅酶A生成苯环氧化的苯乙酸以及辅酶A,但是其催化效率却只有大肠杆菌的百分之一。位于中心α螺旋的上的残基Asp65,通过单点突变实验证明该位点是催化反应所必须的。 通过RT-PCR在小鼠中的组织表达特异性表明,该蛋白在肾脏中有大量的表达,同时在大肠,小肠,脑,前列腺,子宫,睾丸中都有表达,而在胃中没有检测到有表达。关于细胞内的定位,利用两种独立的方法,即绿色荧光融合蛋白以及免疫荧光的方法都检测到该蛋白可能结合在微管上面。当细胞进入分裂期后,该蛋白的分布明显呈现出纺锤体的分布模式,利用免疫荧光的方法与β-tubulin的共定位实验证明该蛋白和微管蛋白是共定位的。通过siRNA敲减的细胞克隆形成实验证明,hTHEM2的敲减可以抑制癌细胞HCT116的生长。 来源于人的P38细胞质T3结合蛋白,也叫做Mucrystallin,在把甲状腺素T3从细胞质转运到细胞核以及在调控甲状腺荷尔蒙相关基因的表达方面起到非常重要的作用。我们利用悬滴法获得了该蛋白的单晶,并且在室内X光源上收集到一套2.6埃的晶体数据。使用分子置换法成功解析了相位并最终修正到2.6埃。晶体结构显示该蛋白可以分为两个结构域:二体化结构域以及NADPH结合结构域。分析发现不对称单位中的两个分子中的Pro90具有顺反异构的现象。通过与同源蛋白的结构比较我们提出了Mu crystallin与T3的结合模型。
其他文献
量子力学的发现和信息理论的产生无疑是二十世纪极其重要的两个事件,这两者结合的产物是量子信息科学,量子信息科学呈现出与经典信息科学截然不同的崭新面貌,在很多方面表现出明显的优势。比如,利用量子态的相干叠加性,人们提出了量子并行算法,用以解决诸如大数因式分解等经典计算无法解决的问题。又如,量子不可克隆定理使得量子信息不能像经典信息那样可以被任意复制,这使得人们能够建立起绝对安全的量子密码系统。再如,量
学位
本论文主要介绍了我们对CF2Cl2分子外价壳层轨道的电子动量谱学研究,特别是利用能、动量多道的高能量分辨电子动量谱仪详细研究了该分子外价壳层轨道的排序问题,并给出了明确的结论。本论文还介绍了我们用能量多道的电子动量谱仪对CFCl3分子外价壳层轨道所做的实验研究,并通过比较CF3Cl,CF2Cl2和CFCl3分子外价壳层轨道的电子动量分布,系统研究了这个系列分子外价轨道的特性。 本论文共分为四
学位
核磁共振(NMR)是一种很好的研究蛋白质空间结构以及蛋白质与其他分子相互作用的结构生物学工具,同时利用核磁共振与计算生物学相结合的方法可以更好地从结构层面探索蛋白质分子是如何发挥生物学功能的。本论文工作的重点是人泛素类相关修饰蛋白质SUMO-3带有单点突变的截断蛋白SUMO-3C47S的克隆、表达、纯化和溶液结构测定以及它与SUMO化路径中的缀合酶Ubc9的相互作用研究。论文分为以下两个部分:
学位
表面电子能谱学中表面激发现象本质上是弹性散射和其他一些非弹性散射的竞争过程,因此,在用表面电子能谱进行定量分析时,关于表面激发对电子能量损失谱的影响的知识是非常重要的。本文在电子复自能的框架下研究了电子在表面附近区域运动时的非弹性散射,其理论方法是基于量子力学处理电子与半无限大介质相互作用问题,其中采用了体的光学介电函数。电子复自能的虚部给出了空间和角度相关的微分倒数非弹性平均自由程(DIIMFP
广义次序统计量是序贯次序统计量的一个子类,包含了许多概率统计中常用的有序变量的模型,例如,通常次序统计量、记录值、k-记录值、Pfeifer记录值、累进Ⅱ型删失次序统计量、多维不完全修理次序统计量,等等,广义次序统计量为我们提供了适当的方式来解释这些所含模型的相似性,通过将已有结果的推广和已有性质的综合,使得对这些模型结构的认识更加清楚,本文主要研究了广义次序统计量以及其间隔在几种常见随机序意义下
现实生活中,人们常用随机变量或向量来描述与某事物及与其发展相关的不确定性因素,而影响事物存在和发展的不确定因素即这些随机变量彼此之间的相互依赖制约关系是统计相依理论的主要研究对象,本文主要研究了两种特殊的随机向量,即通常次序统计量和多维伯努利随机向量的若干正负相依性质。 首先,对于球盒模型中占有数随机向量B=(B1,…,Bn),我们证明了,对于任意的单调递增函数φ:R|L|→R,IE[φ(B
统计相依与随机比较理论在应用概率、统计、可靠性理论、运筹学、精算科学等领域有着广泛的应用,本文致力于研究位置独立风险序和剩余财富序的卷积封闭性质,广义次序统计量的多维分散序,以及隐变量模型中的回归相依性质。 首先,我们研究了位置独立风险序关于卷积的封闭性质,以单调风险为背景,借助于分散序和位置独立风险序的“静态比较”结果形式的刻画,以及位置独立风险序的生成过程,建立了位置独立风险序关于卷积封
阐述在计算机软件系统的项目管理实践中,不仅采用高质量的研发软件和技术,还要将改善和增强软件的生产过程作为核心,实行合理、规范的软件研发过程管理与软件项目监管,探讨计算机软件项目管理中的问题和应对措施。
本文针对当前宇宙学数值模拟中,在研究暗物质晕密度轮廓等已经进入非线性演化阶段的小尺度结构时,由于质量分辨率所带来的一个物理偏差进行分析。这里我们参照星系动力学中对球状星团的讨论,分析它对数值模拟中可能受到的此偏差带来的影响。 第一章首先介绍了宇宙学中暗物质被观测到存在的证据,及粒子物理中的暗物质粒子候选者。然后介绍了随着计算机技术的发展,数值模拟方法被日益广泛地在许多天体研究中得到的应用:大
学位
p-q拉普拉斯方程组与流体力学密切相关,来源于非牛顿流体问题的研究,并在拟正则性和拟投影映射等理论中有所涉及。因为有着极其广泛的应用背景和深刻的研究价值,近年来关于p-q拉普拉斯方程组解的存在性和不存在性问题受到了国内外学者越来越多的关注。本文主要从偏微分方程的角度,具体分为四个部分来研究p-q拉普拉斯方程组全局正解的存在性问题。前言部分介绍该问题的实际背景、研究进展以及本文的主要工作和有待解决的