随着中国经济进入新常态,国家深入推进供给侧改革,一批传统行业的上市公司的业务受到冲击,市值低迷。与此同时,在新兴行业的一些拥有技术优势的企业亟需资本来把握市场先机。于是就涌现出了传统行业企业并购新兴行业企业的浪潮,传统企业可通过并购来实现产业转型,提升公司市值,新兴企业可通过并购进入资本市场,快速融资并将主业发展壮大。但由于新兴行业中的企业往往都具有高技术含量,高附加值等特点,所以在评估这些企业的价值时难度较高,并购方面临着较高的溢价风险。在此背景下,业绩补偿协议得到了广泛的应用。业绩补偿协议作为一种防范并购中标的估值虚高的重要机制,在股份改革时期的并购交易中发挥了缓解信息不对称、保障标的公司业绩、保护中小股东利益等重要作用,但随着第三方并购交易的兴起,近几年却出现了一些企业由于标的公司业绩不达标,而陷入业绩补偿纠纷的窘境。业绩补偿协议在并购中是否能发挥预期作用成为人们关注的问题。为探究这一问题,本文在现有对业绩补偿协议作用研究的基础上,结合信息不对称理论、信号理论、激励理论阐述业绩补偿协议在并购中发挥作用的机理,再以百花村并购华威医药的案例为研究对象,分析业绩补偿协议在此案例中实际发挥的作用,指出应用效果不佳的原因,并提出相关建议,为其他企业并购中签订业绩补偿协议作参考。通过研究发现,在当前市场经济并不完善的大环境下,并购中签订的业绩补偿协议在发挥积极作用的同时,也会衍生出一些风险,有时会使企业面临更大的挑战。所以,企业要谨慎选择标的企业,运用业绩补偿协议前进行充分的尽职调查,在设计业绩补偿协议时,根据自身所处环境,灵活制定条款。并购后要完善监督机制,加强对标的公司的监督。