20世纪90年代以来，随着社会主义市场经济体制的逐步确立，我国高等教育管理体制的改革进入了一个全新的阶段，其涉面之广，时间跨度之大，震撼力之强是前所未有的。此次改革，使得许多高校通过合并重组、自身拓展等方式形成具有大学基本属性的社会组织共性，在校生规模达三四万以上的巨型大学(multiversity)。据统计，截至2005年3月，先后有1064所高校合并组建为405所多学科或综合性的高校。巨型大学，是指上世纪末多所学校合并而形成的规模宏大、师生众多、校园分散的一所大学或多所同名的大学群。这样的高校，校区数量、占地面积、在校生规模、教职工总数都成倍增加，原有的管理方式很难适应多校区、多层次办学的新型大学发展的要求，高校的行政管理、后勤保障、人事管理、教学管理、科研管理及其他附属单位的管理都面临严峻挑战。由于来势猛，过程短，不可能像国外巨型大学那样逐渐积累经验，制订对策，探索理论，而是一连串难题迎面而来；其次虽然国外巨型大学的模式与经验可资借鉴，但中国的巨型大学，无论其成因、体制、环境都与国外巨型大学大不相同，因此，在巨型大学运行且又缺乏现成经验的情况下，如何进行管理创新，领导和管理好这些巨型大学，是高等教育管理的一个非常重要的现实问题。 本文主要从以下几个方面研究目标管理在合并型巨型大学中的应用问题：(1)目标管理理论及对合并型巨型大学管理的借鉴；(2)合并型巨型大学的特点及实施目标管理必要性；(3)合并型巨型大学目标管理的现状分析；(4)完善合并型巨型大学目标管理的策略。 本论文就目标管理在合并型巨型大学行政管理中的应用问题进行了理论分析，通过广泛搜集相关文献和资料，借鉴和吸收这一研究领域的有关成果和观点，力求将目标管理运用于合并型巨型大学的管理活动之中，探索科学合理的管理方法，积极实现其管理目标，提高合并型巨型大学管理的效率。