目的:本课题利用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中的基因芯片识别口腔鳞状细胞癌组织与癌旁组织显著差异表达的基因,以获得新的生物标志物或潜在口腔鳞状细胞癌治疗靶点。方法:通过公用数据库GEO提供的在线分析工具GEO2R对GSE23558、GSE37991和GSE138206的基因表达谱进行分析。在每个GEO数据集中筛选差异表达基因后,在口腔鳞状细胞癌组织中获得212个差异表达基因。利用京都基因与基因组百科全书和基因本体论进行富集分析,探讨上述差异表达基因的生物学功能和参与的信号通路。构建蛋白-蛋白相互作用网络后将数据导入Cytoscape软件寻找核心基因并将其可视化。从Kaplan Meier-plotter数据库中分析核心基因与头颈部鳞状细胞癌患者相应的总体生存信息。最终利用GEPIA数据库对与生存率密切相关的候选基因表达进行验证。结果:通过上述方法,我们成功筛选出212个差异表达基因,与癌旁组织相比口腔鳞状细胞癌中表达上调的基因为74个,表达下调的基因为138个。核心基因16个,其中与口腔鳞状细胞癌预后密切相关的基因有6个,分别为极光激酶A(Aurora kinase A,AURKA)、极光激酶(Aurora kinase B,AURKB)、细胞凋亡抑制因子5(baculoviral IAP repeat containing 5,BIRC5)、细胞分裂周期蛋白6(cell division cycle 6,Cdc6)、E2F转录因子7(E2F7)、泛素样含PHD和环指域蛋白1(ubiquitin-like with PHD and RING finger domains 1,UHRF1),P<0.05。结论:本课题通过生物信息学分析mRNA基因表达谱,获得口腔鳞状细胞癌与癌旁组织间的差异表达基因。筛选并分析了其中6个核心基因的预后特征,有望成为口腔鳞状细胞癌潜在预后标志物,并可能为肿瘤的治疗提供潜在的靶点。当然,我们还需要进一步的实验来验证我们的结论。