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自从20世纪80年代初期将毛细管电泳(CE)引入分离科学领域以来,高效、快速、进样量小、操作简单、耗费成本低且易于实现自动化等优点促进了毛细管电泳技术得到了迅速发展。近年来,利用毛细管电泳或微芯片电泳技术结合多重PCR技术在食源性致病菌分析中的应用,越来越受到研究者的关注。在这些分析方法中,采用高灵敏度的激光诱导荧光检测多重PCR产物。在这项课题中,利用紫外检测核酸,扩大毛细管电泳分离能力;考察了无胶筛分毛细管电泳(NGS-CE)结合紫外检测多重PCR产物的分析检测方法在三种致病菌产物分析中的应用。灵敏度不高被认为是影响毛细管电泳分离主要限制因素之一,特别是相对于传统的液相色谱技术的方法。在利用毛细管电泳分离检测DNA样本,激光诱导荧光(LIF)作为一个高敏感的检测方法。然而,高度致癌的DNA嵌入荧光探针(溴化乙锭(EB)噻唑橙(TO),等等)需要添加到缓冲液中,因为DNA分子自身不带有荧光基团。在毛细管电泳中,紫外检测是最广泛的检测方式。由于其简便性,灵活性和低成本,大多数商用CE设备使用紫外检测器。但是,由于在柱检测光程短和小的进样体积,导致CE紫外检测的灵敏度比较低。为了解决这个问题,各种不同的在线样品富集方法被应用于CE来分离DNA,包括等速电泳、碱堆积(pH值介导柱上样品富集)和场放大样品进样。
在这项工作中,羟丙基甲基纤维素作为筛分介质和动态毛细管涂层。本课题的创新点在于,利用CE分离DNA片段时,为了改善检测灵敏度和分离度,离子对试剂(四丁基磷酸氢铵,TBAP)首次被应用到了无胶筛分毛细管电泳中。利用比较TBAP-DNA和DNA的紫外吸收光谱来证明TBAP和DNA的相互作用。采用场放大样品进样的在线富集方法来提高检测的灵敏度。DNA片段(100bp~1000 bp)在30分钟完成分离。利用所建立的分离方法,3对引物和3种细菌的PCR产物在25分钟内成功获得分离。每种PCR产物的迁移时间和峰面积的日内相对标准偏差(RSDs)小于2.4%(n=5),日间相对标准偏差小于6.1%(n=1.5)。此外,三种PCR产物片段大小也可估算,并与他们的实际值基本吻合。