四照花亚属植物分布广,形态差异大,种间的系统发育关系至今未得到全面的研究。在对四照花亚属植物性状统计调查的同时,结合叶绿体基因组学分析,全面分析四照花亚属植物的种间关系。为了对四照花亚属植物的性状进行分析,采用形态学常用的度量性状和非度量性状相结合的研究方法,针对其具有明显形态差异的叶片进行研究分析。性状分析结果显示,黑毛四照花、香港四照花、秀丽四照花和大型四照花的可度量性状差异性比较大,而香港四照花和大型四照花的非度量性状分析结果较相似。本次研究通过对采集到的十种四照花亚属植物的样品进行总DNA提取,再从总DNA中分离出叶绿体DNA,然后对其进行质量检测、DNA文库构建、测序、基因组装等步骤,最后对组装好的10个四照花亚属植物的叶绿体基因组进行注释。首次获得了四照花亚属10种植物的叶绿体全基因组序列,十个叶绿体基因组序列的大小为156,965-157,380bp,具有典型的四分体结构,可分为四个区域,LSC区（大的单拷贝区）大小为86,296-86,689bp,SSC区（小的单拷贝区）大小为18,386-18,454bp,还有IRa和IRb（一对反向重复区）大小为26,112-26143bp。十个叶绿体基因都编码131个功能基因,其中有蛋白编码基因86个、r RNA基因8个、37个t RNA。十个物种全基因组中总的GC含量范围为38.12%-38.17%,平均GC含量为38.145%,总的GC含量极差值为0.05%。对十种四照花亚属植物叶绿体基因组的结构特征比对发现,它们都高度保守,而对IR区域边界的比对发现,只有SSC区域上的ndh F基因和ycf1基因有差异。十个物种叶绿体基因组序列中的简单重复序列数量不多,主要分布在LSC区域,占比80%-89%,其次是SSC区域,占比7%-14%,占比最少的是IR区域,为0-8%。为了明确四照花亚属十个物种之间的系统发育地位,通过对叶绿体全基因组、编码区、LSC区、内含子和IR区序列等五个数据集采用最大简约法（ML）构建了系统发育树。其中,用全基因组构建的系统发育树,除了四照花亚属植物外,还用了其它12个外类群作为参照。所形成的5个拓扑结构中,10种四照花的亚属植物的拓扑结构总体差异不大。而根据所构建的系统发育树得出结论,香港四照花和大型四照花亲缘关系很近。结合四照花亚属植物性状分析和叶绿体基因组分析结果,可以得出香港四照花和大型四照花属于同一个种有理论支持。对于黑毛四照花、秀丽四照花、褐毛四照花和东京四照花而言,没有足够的理论依据证明他们属于同一个种。