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过去十年间,单分子生物物理技术得到快速的发展使得从单分子层面细致研究DNA与蛋白质,以及DNA与药物反应成为可能。
顺铂物药物是目前应用最为广泛的抗癌药,具有广谱的抗癌活性。最新的对于顺铂的研究发现它可以使DNA凝聚,这对于研究其抗癌机理至关重要。反铂做为它的同分异构体,在医学上却没有抗癌活性。
本文中在前言部分,我们详细介绍了几种常用的单分子技术包括原子力显微镜、磁镊和光镊的原理、典型实验以及发展趋势,呈现出单分子研究的基本背景。在实验装置部分,我们着重介绍实验中所用到的磁镊的实物装置,以及详细的实验步骤,对我们在实验过程中遇到的问题和解决方法也做了一些介绍,希望对相同领域的研究者有所帮助。
我的具体工作包括:
(1)用纵向磁镊对比研究了cisplatin和transplatin对DNA力学结构的影响。DNA在低浓度transplatin影响下也会变柔软,50μM transplatin会使其驻留长度会从52nm左右降到24nm。而同浓度cisplatin可以使DNA驻留长度下降到1.5nm左右。Transplatin使DNA变软的能力不如cisplatin。当用高浓度transplatin处理DNA的时候,在0.2pN拉力下,DNA可以在秒(17.2小时)内基本完全凝聚。用相同浓度cisplatin处理的DNA会在65000秒(18.1小时)内凝聚。但是他们的凝聚曲线则有着明显的区别。有趣的是,当药物用总浓度一样的transplatin与cisplatin混合物以一定比例处理后,会在48000秒(13.3小时)内凝聚。在体外的实验表明,transplatin跟cisplatin与DNA相互作用时具有协同作用,适当比例的transplatin可以明显加强cisplatin使DNA凝聚的作用。
(2)E.coli实验表明cisplatin对细菌有一定的毒性,它的同分异构体transplatin却几乎没有毒性。但是将transplatin与cisplatin结合使用时,就可以表现出比单纯的cisplatin更加强烈的毒性。也就是说,transplatin可以加强cisplatin对于E.coli的抑制作用,二者具有一定的协同作用。