孔子一生著述甚丰,其编纂的六部儒家经典及其门人和后世弟子辑录的《论语》、《礼记》,不仅较好保持了古代文献原貌,反映了孔子的政治理想和教育思想,也记述了大量古代科学知识,形成了儒家独特的科学思想。孔子的科学思想虽散见于各经典中,但体系较完整,包含着丰富的天道观、地道观、人道观等思想。孔子的科学思想包含着强烈求真创新的探索精神、鲜明知德无神的科学特质、浓厚惜生爱物的人文关怀、科学敬天畏命的规律意识。深入发掘孔子科学思想,汲取其天道贵生、客观求实、为仁从善的科学智慧,有助于我们防范科技进步这把“双刃剑”对人类可能造成的伤害。澄清对孔子科学思想的历史误读、追寻其科学思想的现实价值,为儒家科学思想正本清源,是当代科学哲学研究的重要学术任务。孔子的科学思想是后世儒家科学思想的源头。孔子曾问道老子,获得对自然规律演化之“道”的领悟,为其在《易经》中探讨自然变生的条件、推导卦历演化的规律乃至阐释宇宙运动的法则,提供了科学观测的方法论。在此基础上,孔子又记载了大量天文现象、解析了春秋寒暑、推演了农时历法,还记录了大量古代动物植物、山川河泽、气象水文以及各种地质灾害现象,甚至提出了大衍之数的万物运演假说、阴阳合气的生命起源假说、顺时养生的天道性命假说,较系统地形成了独树一帜的天道观、地道观和人道观思想。孔子在科学上的理论探索与深入思考,是中国古代科学原创时期的重要成果,也为多个学科“经世”之用的自然研究提供了理论和方法。不过,孔子鄙视无“经世”之用的自然研究,也不尚工巧,也给中国古代科学技术发展带来了很大困扰。去其糟粕,取其精华,则可为我们当代推动科技进步提供有益历史借鉴和思维启迪。