牙根纵裂患者窦道内微生物16SrDNA测序分析与比较研究

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目的本实验利用16Sr DNA微生物测序技术对牙根纵裂、慢性根尖周炎(有窦型)以及牙周脓肿的感染患牙窦道中微生物菌群之间的多样性及特异性进行分析,为疾病的鉴别诊断、特异性诊疗手段的实施以及预后评估提供理论基础。对象和方法收集天津医科大学口腔医院综合科收治的牙根纵裂、慢性根尖周炎(有窦型)以及牙周脓肿病例,按照问卷调查表记录相关详细信息,并严格按照纳入、排除标准纳入病例,共24例。其中包括牙根纵裂病例7例,慢性根尖周炎(有窦型)病例9例,牙周脓肿病例8例。采用16S微生物检测技术进行微生物菌群的抽提质检,对所得序列结果进行分析。按照97%的相似度进行聚类,得到操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs)的代表序列,并进一步按照界、门、纲、目、科、属、种6个水平研究具体OTUs和微生物的群体种类。对所得样本数据进行Alpha分析、Beta多样性分析、物种分类学分析、微生物间相关性分析以及高级分析。结果在97%相似性水平下对OUT进行生物信息统计分析,共获得4134个OTUs。归属于33个门(Phylum)、80个纲(Class)、178个目(Order)、321个科(Family)、735个属(Genus)、1226个种(Species)。Goods_coverage均在99%以上,样本内大部分序列均已被检出。Shannon曲线、Simpson曲线以及稀释曲线显示研究中样本检测所选数据量合理。在门水平上,拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、螺旋体门(Spirochaetes)检出率最高。梭杆菌门在牙根纵裂组检出率高于慢性根尖周炎(有窦型)组以及牙周脓肿组;拟杆菌门在牙周脓肿组中检出率高于牙根纵裂组以及慢性根尖周炎(有窦型)组,差异具有统计学意义(P<0.05)。在科水平上,牙根纵裂组中梭杆菌科、纤毛菌科、黄杆菌科以及β-变形菌科检出率较高(P<0.05);慢性根尖周炎(有窦型)组中检出率较高的为真杆菌科、菊科、景天杆菌科(P<0.05);在牙周脓肿组中螺旋体科、互营单胞菌科以及无胆甾原体检出率明显高于另两组,差异均具有统计学意义(P<0.05)。在属水平上,纤毛菌属、梭杆菌属、β-变形菌属以及噬二氧化碳纤维菌属(Capnocytophaga)在牙根纵裂组丰度较高(P<0.05)。斯莱克氏菌属(Olsenella)、普雷沃氏菌属(Prevotella)、气微菌属(Aeromicrobium)以及Petospora在慢性根尖周炎(有窦型)检出率较高(P<0.05)。在牙周脓肿组中,沃廉菌属(Wolinella)、无胆甾原体(Acholeplasma)检出率高于另外两组,新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium)检出率低,差异均具有统计学意义(P<0.05)。绿菌门种属(Chloroplast_unclassified)菌群在慢性根尖周炎(有窦型)样本中的检出具有临床指导意义。吸烟情况、患牙松动度以及牙周治疗情况之间呈正相关关系且与牙周脓肿显著相关。沃廉菌属(Wolinella)、产线菌属(Filifactor)与吸烟状况以及患牙松动度之间呈正相关。卡氏菌属(Catonella)与最大探诊深度以及叩痛之间呈正相关关系。结论1.在门水平上,梭杆菌门在牙根纵裂组检出率较高;拟杆菌门在牙周脓肿组中检出率较高,酸杆菌门可能与牙周脓肿的发生发展无直接关系。2.纤毛菌属、梭杆菌属、β-变形菌属、噬二氧化碳纤维菌属在牙根纵裂患牙中检出率高。斯莱克氏菌属、普雷沃氏菌属、Petospora、气微菌属可能与慢性根尖周炎(有窦型)的发生发展相关。沃廉菌属、无胆甾原体菌属可能与牙周脓肿的发生发展相关。绿菌门种属菌群对慢性根尖周炎(有窦型)的诊断及鉴别诊断具有临床指导意义。3.不同微生物与临床观察指标之间存在相关关系。
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