基于转录组测序的茯苓酸生物合成途径研究

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:miclleg
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
茯苓(Wofiporia cocos (Schw.))是担子菌门的一种腐生真菌。茯苓的干燥菌核在东亚广泛用于传统药材,在中国,其菌核更是享有万能药的美誉。茯苓有消炎抗肿瘤等多重功效,三萜类化合物是茯苓的主要活性成分之一。但是茯苓中该类化合物的生物合成却罕有研究。本文着力研究茯苓活性成分三萜类化合物茯苓酸的生物合成途径及该途径中关键酶的作用。本试验以第二代高通量测序为平台,对同一株茯苓的菌丝和菌核分别进行转录组测序。主要研究结果如下:1)通过高通量测序,在菌丝样品中得到了38722186个Reads,共3484996740bp的核苷酸序列,其中质量高于20的比例为96.21%,不确定的碱基比例为0.01%,碱基G、C含量比为58.48%。在菌核样品中得到了39710244个Reads,共3573921960bp的核苷酸序列,其中质量高于20的比例为96.52%,不确定的碱基比例为0.01%,碱基G、C含量比为58%。通过有效Reads的组装,在菌丝中得到了60354个Contig,共30359057bp的核苷酸序列,每个contig的平均长度为503bp,N50是第765个congtig。在菌丝中得到42037个Unigene,其中可识别的序列簇为1098个,可识别的单一序列为40939个;共27146481bp的核苷酸序列,平均每个Unigene平均长度为646bp,N50是第814个Unigene o在菌核中得到了56938个Contig,共33305946bp核苷酸序列,每个contig的平均长度为585bp,N50是第991个congtig,在菌核中得到38533个Unigene,其中可识别的序列簇为1313个,可识别的单一序列为37220个;共29546864bp核苷酸序列,平均每个Unigene平均长度为767bp,N50是第1037个Unigene.2)通过Unigene功能注释,27325个Unigene中,11796个Unigene注释到GOC库中,其中有25个功能分组;2574个Unigene注释到GO库中,其中分3大类进行功能注释,30个功能分组;16386个Unigene注释到KO库中,其中有108个功能分组;27143个Unigene注释到NR库中;17469个Unigene注释至IJSWISSPROT库中。3)通过Unigene代谢通路分析,得出茯苓中三萜类化合物茯苓酸的前体物质羊毛甾醇的生物合成途径。4)通过荧光定量PCR验证,得出在菌丝阶段表达量上调的酶的编码基因为Unigene12366、Unigene20430、Unigene14106、Unigene21656。Unigene6395。5)通过对同一株茯苓不同时期(菌丝和菌核)总三萜和茯苓酸含量的测定,得出茯苓菌丝和茯苓菌核中的总三萜和茯苓酸含量存在差异。其中菌丝总三萜含量为5.36%,茯苓酸含量为0.458%;菌核总三萜含量为1.43%,茯苓酸含量为0.174%。6)通过Realtime-PCR技术,检测茯苓酸的生物合成途径中对关键酶起调节作用的基因表达量,与转录组测序分析得到结果相一致。
其他文献
该文合成了25个N—芳基—N—[2—氯—5—吡啶甲基]硫脲类化合物(D).其结构通过HNMR、IR谱及元素分析的确认.并对合成方法及化合物的波谱性质进行了分析.初步的生物活性测定表
目的观察多西他赛联合表柔比星(TE方案)密集新辅助化疗治疗局部晚期乳腺癌(locally advanced breast cancer,LABC)的疗效和毒副作用。方法收集济宁市第一人民医院乳甲外科200
该文就九种常见的菊科植物对菜粉蝶、小菜蛾、斜纹夜蛾等多种害虫进行生物活性测定,从中筛选出较高拒食活性植物金腰箭(synedrellanodiflora),进一步对金腰箭活性成分进行初
该文第一章综述了赤眼蜂的应用研究进展、赤眼蜂与农药的协调研究和烟青虫的防治现状.该文第二章比较了不同地域和寄主的松毛早赤眼蜂HJS、GGS和YYS品系和螟黄赤眼蜂JDM、HMM
该研究采用常规的鉴别寄主反应法,对新疆(南疆为主)棉花枯萎病菌生理小种进行了测定,并使用聚类分析,对病菌生理小种或致病类型进行划分.同时对目前国内外报导的几种棉花枯萎
阿维菌素是一组天然存在的大环内酯化合物,具有广谱的驱虫、杀虫活性.显著的生物活性和复杂的分子结构吸引了无数的化学工作者对其进行研究.许多经结构改造的衍生物具有更好
为明确河南省烟草根部、茎部真菌病害的种类及烟草黑胫病菌生理小种的类型,试验选择河南省登封市、邓州市、济源市等15个植烟县进行调查,通过组织分离法对病原菌进行分离、纯化
“3分钟立等止痛”这是郁鑫膏的宣传口号。但3分钟,绝对不是夸夸其谈,而是经过无数患者验证之后得出的结论。为什么见效这么快?因为郁鑫膏是纯天然中草药提纯精制而成,与市面
农药泡腾版剂具有运输、使用方便,易定量,对环境、人员安全的特点.在取代污染严重的传统农药剂型乳油、可湿性粉剂、粉剂、颗粒剂方面,它具有潜在开发前景.该论文选用对人畜
对抗性组蜂螨和敏感组蜂螨进行了对氟氨氰菊酯的抗药性测定,发现抗性组蜂螨的LC50是敏感组蜂螨的40.99倍,说明抗性组蜂螨已经对氟氨氰菊酯产生了较强的抗性.测定了增效醚PBO(