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在现代的计算机辅助药物分子设计中，分子匹配和对接是最活跃
的研究内容之一。由于以往的方法只能应用于小分子的相似性及生物
大分子与小分子的对接上而对于大分子则显得无能为力。
本文利用球谐函数，成功的模拟出生物大分子的表面，以及分子
的旋转等的表达，并将其应用在生物大分子与生物大分子之间的匹
配、对接上。基于计算量的巨大，同时引入了遗传算法来提高分子对
接的速度。
论文过程中我们选取了乙酰胆碱汁酶分子作了分子匹配的试验，
对于对接，在PDB蛋白质分子库中选取一部分分子内部含有受体、
配体两部分的分子做了对接试验，同时改进了对接时的评价函数以提
高对接的准确度，为药物分子设计的研究奠定理论基础。