榕树在热带地区被广泛用于美化环境，并以其非凡的气生根而著称。榕树是桑科植物中种类最多的一种，与传粉者紧密结合构成一个共生系统。大约有一半的榕属植物在功能上是雌雄异株的，这与雌雄同株榕属植物的不同之处在于，雄树结出的果实能产生功能性雄蕊和孕育榕小蜂的非功能性雌花（即瘿花），而雌树含有可以产生种子的功能性雌花和退化的雄花。先前的研究报道RAN1基因是决定无花果（F.carica）性别的关键基因。然而，它可能不是榕属植物唯一的性别决定系统。
　　本研究基于基因组学、遗传学、分子生物学等方法，探索榕树的性别决定机制，以对叶榕（F.hispida）为主要研究材料，收集对叶榕雌雄果实的三个主要发育时期样品，分析其性染色体的遗传结构、性别区域、演化方式以及表达模式。主要研究结果如下：
　　1.性别决定基因的鉴定：通过采集来自同一母本的种子并培育幼苗，对其中30株雄性F1代植株和30株雌性F1代植株及其母本进行全基因组重测序，将重测序数据与对叶榕参考基因组进行比对，检测每条染色体的单核苷酸多态性（SNP），分别构建父本和母本遗传图谱。在10号染色体的前2Mb区域检测到一个非重组区域，作为性别决定候选区域，在这个区域中仅包含一个MADS box转录因子Fh.10G0000020，对该基因进行转录组分析，其结果显示该基因在对叶榕的雄花发育时期高表达，在雌花、叶片、根中均不表达，表明了该基因可能是对叶榕的性别决定基因。功能分析显示，该基因为AGAMOUS（AG）基因家族的一个成员。
　　2.对叶榕性别决定基因的演化研究：系统发育树分析表明，雌雄同株的小叶榕含有1个AGAMOUS基因拷贝（FmAG），而雌雄异株的对叶榕存在3个拷贝（FhAG1、FhAG2和FhAG3），其中FhAG2和FhAG3分别为雄性特异性拷贝数。进一步分析表明，FhAG1与FmAG是直系同源，且两者所在的基因组区间存在大片段的共线性。而FhAG2、FhAG3与FhAG1互为旁系同源，前两个基因是FhAG1的复制和拷贝。这一结果表明，FhAG1是对叶榕AG基因的祖先拷贝，维持了祖先基因中控制雄蕊和心皮发育的功能，而FhAG2和FhAG3起源于FhAG1基因的复制，并发生新功能化，成为对叶榕控制性别决定的候选基因。
　　3.对叶榕性别调控基因网络的构建：基于雌雄异株对叶榕果实转录组数据，在果实主要的三个发育时期一共鉴定了1,818个性别差异表达基因。差异基因的功能富集分析的结果表明，9个基因调控对叶榕花原基发育网络。利用转录起始位点（TSS）的上游2Kb序列作为潜在的顺式元件结合位点，计算基因之间的皮尔森相关系数（PCCs），预测了14个可能参与FhAG2基因调控网络的基因。FhAG2、Fh.04G0001990、FhAG3在网络中为其他差异表达基因的上游调控基因。