【摘 要】
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特异性免疫中抗原的类别有外源性和内源性之分,外源性抗原是指由其它细胞（如细菌、真菌）产生被专职性抗原提呈细胞摄入的抗原。内源性抗原主要是指在非专职性抗原提呈细胞（如病
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特异性免疫中抗原的类别有外源性和内源性之分,外源性抗原是指由其它细胞（如细菌、真菌）产生被专职性抗原提呈细胞摄入的抗原。内源性抗原主要是指在非专职性抗原提呈细胞（如病毒感染细胞、肿瘤细胞）内部合成的抗原。内源性抗原在细胞液中被蛋白酶体分解为不同长度的短肽[1],镶嵌在内质网膜上的跨膜转运蛋白（TAP）可以选择性的结合部分短肽,并且在ATP供能下把抗原肽由细胞液转运至内质网腔[2],在质网腔中与新组装的MHC-I类分子结合,二者聚合物经过高尔基体运送到细胞膜上,被CD8+T细胞识别。本文的主要工作是用支持向量回归机（SVR）算法预测抗原肽与TAP分子的结合力,向量机的训练集是和TAP分子有已知亲和力的九肽的数据集（613个9肽）,用决定系数R2和均方根误差RMSE作为评估模型预测性能指标。结果表明,对肽结合到TAP分子影响最大的是C-末端（P9）位置上的氨基酸,其次是P1、P2和P3位置上的氨基酸。剩余的其它位置上的氨基酸对肽与TAP分子的结合也有一定的影响。
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