番茄（Lycopersicon esculentum Mill）是自花授粉作物，杂种优势十分明显，杂交种比普通品种增产20％-30％以上，而且整齐度高，抗逆性强。因此番茄雄性不育的研究对于番茄杂交育种非常重要。 我们从保加利亚引入含雄性不育基因ps-2的品系CMC，从中选出CMClps2进行研究，发现它在北京地区生长正常，雄性不育性状表现优良，花药不开裂，花粉活力正常，通过人工自交授粉可获得100％的不育后代。而且，以其为母本与可育的父本进行杂交，可得到育性正常的F₁代，该品系可以用来杂交育种。 本试验以CMClps2为母本，优良的加工番茄92155为父本，构建了123个F₂代分离群体，田间调查结果表明，育性表型分离比例完全符合孟德尔遗传规律，为单基因隐性遗传。采了AFLP，SSR，CAPS三种分子标记技术，通过筛选64对AFLP引物组合，5对SSR引物以及13对CAPS引物，最终获得了与不育基因ps-2紧密连锁的3个AFLP标记（E37／M47、E38／M48、E33／M50），1个SSR标记（SSR450），1个CAPS标记（PStg123），它们与不育基因的遗传图距分别是6.04cM、6.04cM、6.06cM、4.937cM、11.591cM；由于父母本遗传背景相似，E37／M47、E38／M48、E33／M50以及SSR4504个标记位于基因的同一侧，并且位置基本相同；PStg123这一标记位于基因的另一侧，位置较远。这5个标记中，3个AFLP标记均为显性标记与可育基因连锁，另外两个标记为共显性标记。这5个标记的获得，可直接用于标记辅助选育和杂种纯度鉴定，加速番茄雄性不育的转育和利用。 另外，为了将成本高、操作复杂的AFLP标记转化为成本较低、操作简便的SCAR标记，还对E37／M47这一标记所扩增得到的特异性片段进行了回收纯化的工作，通过测序得到一条大小为392bp的DNA序列，这为以后进一步研究番茄ps-2雄性不育基因的序列、克隆基因、转基因等研究打下了基础。