普氏蹄蝠的皮肤微生物组研究

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动物的雌性个体常常倾向于选择特定的雄性作为配偶,雄性个体间也会通过性别内的直接竞争决定交配机会。无论哪种方式的性选择,获得更高生殖成功率的雄性通常在体格、健康程度、免疫力等方面有更高的优势,最终提高了后代的适合度。相关研究发现,动物的皮肤微生物组的特征与宿主的免疫力、健康状况等有密切关系;与此同时,宿主的遗传背景也常常对其皮肤微生物组的组成与结构有着重要影响。普氏蹄蝠存在典型的性别二态性,雄性个体头部的顶叶器官存在明显的大小差异,具有更大顶叶的雄性蝙蝠被认为在性选择中处于更高的优势地位。本文以普氏蹄蝠(Hipposideros pratti)为研究对象,通过对不同顶叶大小的雄性普氏蹄蝠皮肤微生物组的比较分析,揭示其顶叶形态特征与皮肤微生物组特征之间的关系。本研究通过拭子法采集雄性普氏蹄蝠的皮肤微生物,并进行16S rRNA高通量测序。在对测序结果进行质控、拼接、分类注释、多样性分析、网络结构构建、差异分析和功能注释等相关分析后,我们发现雄性普氏蹄蝠皮肤微生物群落主要有4个优势菌门,分别为拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和绿菌门(Chlorobi),占皮肤微生物总量的93%。不同顶叶大小的雄性普氏蹄蝠皮肤微生物群落的物种多样性无明显差异,但是在群落结构上呈现出明显差异,并且大顶叶组具有更加复杂而稳定的微生物群落,而小顶叶组个体之间微生物结构差异较大。通过随机森林和LEfSe分析,发现4种菌属对普氏蹄蝠皮肤微生物差异产生影响,分别是不动杆菌属(Acinetobacter)、密螺旋体属(Treponema)、乳杆菌属(Lactobacillus)、Gemmiger,其中不动杆菌属在小顶叶组中多度明显增加。通过功能注释发现在小顶叶组中高表达的通路有原发性免疫缺陷、金黄色葡萄球菌感染、致病性大肠杆菌感染等,其中原发性免疫缺陷与不动杆菌属相关。本研究发现普氏蹄蝠的皮肤微生物组成及群落结构存在差异,进一步丰富了对蝙蝠皮肤微生物的研究。鉴于已有研究和上述实验,推测雄性普氏蹄蝠中大顶叶个体比小顶叶个体具有更良好的健康状况,暗示了顶叶形态特征在普氏蹄蝠性选择机制中的作用,这为今后开展普氏蹄蝠性选择的遗传学研究提供了新的参考。
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