基于转录组测序技术分析HSV-1感染小鼠和树鼩的免疫反应

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[目的]建立不同感染时间点小鼠和树鼩HSV-1感染模型,观察小鼠和树鼩疱疹性角膜炎的的发病进程,通过对不同感染时间点三叉神经节进行RNA-seq测序,分析HSV-1感染小鼠和树鼩后三叉神经节中主要的涉及的免疫反应,为树鼩HSV-1感染模型的推广及HSV-1感染免疫发应的研究提供基础数据。[方法]角膜划痕法接种HSV-1 17+病毒建立小鼠和树鼩感染模型。将成年树鼩60只,随机分为对照组(6只)和实验组(54只),健康BALB/c小鼠100只,随机分为对照组(6只)和实验组(94只),实验组小鼠和树鼩两只眼均为手术眼,做角膜划痕病毒感染模型,对照组小鼠和树鼩两只眼睛仅做划痕不接种病毒。在 3dpi、5dpi、7dpi、10dpi、14dpi、28dpi、58dpi 7 个时间点进行角膜裂隙灯拍照和取材三叉神经节,保证每个时间点至少有6只动物。裂隙灯拍照观察小鼠和树鼩疱疹性角膜炎的发病进程。一部分三叉神经节取材后液氮速冻,提取组织RNA送往武汉华大公司进行RNA-seq测序,另一部分三叉神经节提取RNA,PCR检测病毒DNA。数据分析HSV-1感染后小鼠和树鼩三叉神经节中涉及免疫反应的基因和信号通路。[结果]PCR检测小鼠和树鼩三叉神经节中病毒DNA结果:两对引物在小鼠和树鼩7dpi三叉神经节中均检测到HSV-1阳性产物,确定建立了小鼠和树鼩HSV-1感染模型。裂隙灯观察小鼠和树鼩疱疹性角膜炎病变进程:HSV-1感染小鼠和树鼩后角膜观察到了树枝状和地图样溃疡病灶,小鼠疱疹性角膜炎急性期眼表的炎性反应强烈,58dpi后大部分小鼠角膜遗留瘢痕,而树鼩疱疹性角膜炎的炎性表现比较温和,两只眼睛眼表的炎性反应严重程度差别不大,58dpi后大部分树鼩角膜恢复正常。小鼠和树鼩三叉神经节中HSV-1病毒基因表达分析结果:HSV-1感染急性期小鼠病毒基因的表达数目和表达量高于树鼩,其中在HSV-1感染小鼠急性期表达而树鼩急性期不表达的基因有ICP4、UL3、UL4等12个基因。HSV-1感染小鼠潜伏期只表达LAT,而树鼩潜伏期除了 LAT以外有ICP0、ICP22、UL6、UL34等10个病毒基因的表达。HSV-1感染小鼠TG中涉及免疫反应的宿主基因表达分析结果:大部分基因表达上调,其中 CXCL9、CXCL10、CXCL11、CD8A、CD8B、KLRD1 等基因,参与调节CD8+T细胞信号通路,活化的CD8+T细胞通过分泌颗粒酶B(GZMB)发挥细胞毒性作用,抑制HSV-1的感染和潜伏期重激活。而IL18BP、IFNG、JCHAIN等病毒基因,编码参与CD4+T细胞信号通路。HSV-1感染树鼩TG中涉及免疫反应的宿主基因表达分析结果:大部分基因表达上调,小部分基因表达下调。参与调节CD8+T细胞信号通路的基因包括CXCL9、CXCL10、CXCL11、CD8B等。而整个感染周期都表达的HLA-DPA1、HLA-DQA2、HLA-DRA、HLA-DQB1参与编码MHCⅡ类组织相容性复合物,通过CD4+T受体信号通路发挥免疫调控作用。[结论]1)小鼠HSV-1感染急性期ICP4的高表达可能是介导TG神经元死亡的主要基因;2)树鼩HSV-1感染潜伏期高表达的ICP0可能是参与潜伏期病毒重激活的重要基因;3)树鼩HSV-1感染的免疫反应表现为CD4+T细胞、CD8+T细胞的联合免疫反应;4)树鼩是优于小鼠的疱疹性角膜炎动物感染模型。
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