USH2A基因相关遗传性视网膜疾病表型和基因型分析

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背景:USH2A是引起2型Usher综合征和非综合征型视网膜色素变性的主要致病基因具有高度遗传异质性。通过HGMD数据库可以检索到896种USH2A基因的变异,这些变异位于整个USH2A外显子和侧翼的内含子部位。变异类型有无义变异、错义变异、截短变异、染色体复制等形式。USH2A基因编码的usherin蛋白在视网膜和内耳具有重要作用。因usherin蛋白结构庞大,对其行使的具体功能尚不明确。目前基因替代治疗的临床试验在部分基因所导致的视网膜色素变性患者中取得了较好的疗效。但是由于USH2A基因过大超过目前常用的载体容量,对其研究仍然主要在动物实验水平,对USH2A基因变异所导致的2型Usher综合征和非综合征型视网膜色素变性尚未取得突破性进展。目的:经过该课题的研究,进一步认识和USH2A基因相关的疾病表型和基因型关联。综合分析基因与临床诊断以进一步确定疾病的发生及严重程度。方法:收集2017年9月至2019年1月在河南省立眼科医院就诊的视网膜色素变性与Usher综合征患者。对研究对象进行详细的眼科检查并采集患者及部分家属外周静脉血。并对部分家系成员进行基于靶向捕获的二代测序分析,Sanger和家系共分离验证。根据测序结果筛选出致病基因为USH2A的家系。对发现的变异进行基因型和表型分析,并对新发现的变异进行保守性和致病性分析。结果:本研究共收集到3个致病基因为USH2A的家系。家系1先证者除有视网膜色素变性的临床表型外还合并有神经性耳聋。测序显示USH2A基因两个新的杂合移码变异,即位于第64外显子的c.13877-13880 del AGAC(p.Q4626Pfs)和位于第5外显子的c.798 del T(p.F266Lfs)。两个变异在多个哺乳动物之间进行同源性分析显示具有高度保守性。这两个变异可提前终止多肽链的合成,引起氨基酸翻译异常、蛋白功能丧失。通过在线工具SIFT、Polyphen2、Mutation Taster预测新发现的变异位点的功能,结果为有害变异。家系2患者和患者的弟弟都有视网膜色素变性的临床表型,无耳聋症状。测序显示USH2A一个新的杂合错义变异,即第37外显子的c.6986C>A(p.P2329H)和两个已知杂合变异即第70外显子的c.15178T>C(p.S5060P)与第29外显子c.5836C>T(p.R1946X)。进行同源性分析显示新的变异在多个哺乳动物之间具有高度保守性。c.6986C>A可能造成氨基酸序列产生变化影响蛋白功能。c.15178T>C可能影响蛋白功能,c.5836C>T是一个终止变异,使蛋白合成提前终止,为致病性变异。家系3先证者有视网膜色素变性的临床特征,无耳聋表型。测序显示USH2A一个位于第68外显子的新的杂合错义变异c.14951C>T(p.P4984L)和一个位于第57外显子的已知变异c.11156G>A(p.R3719H)。在多个哺乳动物之间进行同源性分析显示c.14951C>T具有高度保守性,可能导致氨基酸的序列产生变化影响蛋白功能。结论:本研究中三个USH2A基因变异家系共有7个杂合变异,包括4个新发变异。USH2A基因变异是导致2型Usher综合征和非综合征型视网膜色素变性的主要原因。在三个家系中USH2A基因不同突变位点对蛋白质翻译和合成有不同程度的影响,从而产生不同的临床表型。
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