【摘 要】
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目的:探讨宏基因组二代测序（Metagenomic next-generation sequen cing,m NGS）在儿童重症肺部感染病原微生物检测中的应用价值。方法:回顾性分析2020年7月至2021年12月于我院接受支气管镜治疗并行肺泡灌洗液m NGS病原微生物检测的重症肺炎患儿97例,对比传统病原检测方法和m NGS的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值等,并分析m NGS检测致病原阳
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目的:探讨宏基因组二代测序（Metagenomic next-generation sequen cing,m NGS）在儿童重症肺部感染病原微生物检测中的应用价值。方法:回顾性分析2020年7月至2021年12月于我院接受支气管镜治疗并行肺泡灌洗液m NGS病原微生物检测的重症肺炎患儿97例,对比传统病原检测方法和m NGS的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值等,并分析m NGS检测致病原阳性序列数阈值、m NGS检出阳性结果的影响因素及对临床治疗的参考价值。采用SPSS21.0统计学软件分析数据。不符合正态分布计量资料采用P50(P25,P75)表示;计数资料采用率（%）表示,两种方法的检测结果差异采用Mc Nemar检验,m NGS检测肺炎链球菌、曲霉属、MP与最终临床诊断结果一致性采用Kappa检验分析,m NGS检出阳性结果的多影响因素采用二元logistic回归分析,P值＜0.05具有统计学意义。结果:1.一般情况:97例重症肺炎患儿中,男58例,女39例,无基础疾病者有45例,基础疾病者有52例,其中血液肿瘤疾病34例;年龄为29天～16岁[3.00（1.00,7.00）],使用呼吸支持29例,WBC为[8.10（3.55,12.30）]×10~9/L,CRP为[10.79（1.62,34.90）]mg/L,PCT为[0.15（0.066,0.51）]μg/L,住院天数为[28.00（15.00,47.00）]天。2.两种方法检出病原情况比较:97例患儿中,m NGS检出细菌40例,检出真菌33例,传统病原学方法检出细菌24例,检出真菌21例;m NG S对细菌、真菌的检出率明显高于传统检测方法（41.24%vs24.74%、34.02%vs21.65%）;综合不同患儿临床特征及治疗效果,m NGS检测细菌、真菌的灵敏度显著高于传统方法（58.06%vs32.26%、57.78%vs44.00%）;m NGS检测细菌的阳性预测值显著高于传统方法（90.00%vs83.33%）;m NGS检测细菌、真菌的阴性预测值高于传统方法（56.14%vs46.58%、70.31vs67.11%）。两种方法检测细菌、真菌结果差异,具有统计学意义（P＜0.05）。3.两种方法检测的一致性比较:m NGS检测结果为肺炎链球菌与最终临床诊断结果的一致性较好（Kappa=0.863,P＜0.001）;m NGS检测结果为曲霉菌属与最终临床诊断结果的一致性中等（Kappa=0.738,P＜0.001）。传统方法与m NGS一致的阳性结果:细菌13例、病毒5例、肺炎支原体13例、真菌12例,其中,与m NGS结果一致性较好的传统方法中,检测细菌的一致性较好的是肺泡灌洗液及痰培养各有7例;检测肺炎支原体的一致性较好的是肺泡灌洗液聚合酶链式反应检测有12例;检测真菌的一致性较好的是1,3-β-D葡聚糖检测有6例。两种方法病原检测结果一致的m NGS序列数:检测为细菌的8例m NGS序列数在50以上;肺炎支原体的13例m NGS序列数在700以上;真菌的8例m NGS序列数在15及以上。4.m NGS检出阳性结果的影响因素:利用logstic回归分析发现合并基础疾病、WBC、CRP、PCT、m NGS检测前应用抗感染治疗,对m NGS的结果无明显影响（P＞0.05）。5.m NGS对治疗的指导价值:纳入97例患儿中,61例根据m NGS结果制定抗感染治疗方法,53例治疗有效,有效率为86.89%。结论:1.m NGS对于细菌的检测具有高阳性率以及灵敏度,对临床抗感染治疗具有一定指导价值;2.在真菌感染中,m NGS检测的阳性率、灵敏度明显高于传统检测方法,且与G、GM试验相比,能够提示确切的感染病原;3.对于重症肺部感染患儿,尤其免疫能力低下儿童,易合并真菌感染,m NGS对病原的明确以及抗感染治疗有一定的指导意义;4.对于不同种类的致病原,m NGS检测阳性的序列数阈值可能不同;5.m NGS不受合并基础疾病、检测前是否应用抗感染治疗等多种因素的影响,但判读也需结合采样位置、临床表现、传统技术检测的病原体和其他辅助检查等来综合判断。
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