本论文对广州地区唐鱼形态变异和遗传多样性进行了分析，从形态水平和分子水平研究了五个唐鱼群体的遗传多样性和亲缘关系，以期为唐鱼资源的保护和利用提供参考。这五个群体中三个野生的群体分别采集自从化流溪河水系的唐鱼保护区(BH)、从化巴江水系的岐田村(QT)、增城的小楼镇约场村(YC)，三群体为自然地理隔离群体；人工养殖群体(YZ)由保护区人员提供(亲本来源于广州白云山)；市场群体(SC)购自芳村花鸟市场。 选取唐鱼的29个可量性状和6个可数性状进行测量和计数，用SPSS软件对形态测量数据进行了主成分分析，结果表明，前三个主因子累积贡献率达到了86.698％。其中，对于第一主成分而言，起作用比较大的主要是全长、鳃盖前端上侧至腹鳍起点、鳃盖前端上侧至背鳍起点、吻端至腹鳍起点、体高、背鳍起点至臀鳍起点、体长等23个特征变量；对第二主成分起主要作用的是尾鳍基部下端至臀鳍基后、尾柄长、尾鳍基部上端至臀鳍基部后3个特征变量；对第三主成分起主要作用的是眼后头长、眼间距、眼径、鳃盖前端上侧至胸鳍起点3个特征变量。可以看出，对第一主成分起作用的主要是与个体大小和体形相关的变量，对第二主成分起作的的主要是与尾鳍相关的变量，对第三主成分起作用的主要是头部、眼部的特征变量。各群体的一、二主成分散点图表明，各群体在一、二主成分上有不同程度的重叠，但芳村市场群体(SC)和养殖群体(YZ)主要集中分布在第一象限，二者基本上可以和其他三个野生群体区分开来。根据五个群体间的欧氏距离，用SPSS软件对五个群体进行聚类，发现五个群体分为两支，一支是由养殖群体(YZ)和保护区群体(BH)首先聚合，然后和芳村市场群体(SC)聚合，另一支是由约场村群体(YC)和歧田村群体(QT)首先聚合。 从唐鱼临近物种的40对微卫星引物中筛选出了7个多态性好的位点，并检测了唐鱼在这7个位点上的遗传多态性。五个唐鱼群体在这七个位点上扩增出的条带2—5条不等，扩增片断大小在130-750bp之间。五个群体共150个个体在7个微卫星位点上的总体平均PIC值为0.296。唐鱼保护区(BH)群体的平均PIC值最高，为0.366；市场群体(SC) PIC值最低，为0.232；市场群体(SC)和养殖群体(YZ) PIC值比三个野生群体略低。五个群体平均观测杂合度Ho在0.257到0.410之间，平均值为0.326，其中最高的是约场村群体(YC)，最低的是芳村市场群体(SC)；期望杂合度He在0.274到0.434之间，平均值为0.342，其中最高的是保护区群体(BH)，最低的是芳村市场群体(SC)。五个群体的观测杂合度Ho总体低于期望杂合度He。计算了五个群体群体内和群体间的遗传相似系数。群体内的遗传相似系数最大的为芳村市场群体(SC)0.893、最小的为保护区群体(BH)0.816。根据各群体间的遗传相似系数，采用UPGMA方法，用NTSYS软件对五个群体进行聚类，结果显示，芳村市场群体(SC)和养殖群体(YZ)首先聚合，然后二者共同和保护区群体(BH)聚到一起，然后三者和歧田村群体(QT)聚合成为一支，约场村群体(YC)为单独的一支。