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大肠杆菌CoQ生物合成途径中isopB基因是链长控制基因，编码八聚异戊二烯焦磷酸合成酶。本课题通过异源十聚异戊二烯焦磷酸合成酶编码基因ddsA原位替换大肠杆菌染色体上ispB基因，首次成功构建得到原位替换株JKL，使大肠杆菌在消除了内源性CoQ8合成能力的同时，提高对较长侧链CoQ的合成能力，并且发现在CoQ10、CoQ9生成的同时仍然伴有CoQ8的存在，推测可能是由于大肠杆菌体内潜在的降解机制或(和)外源基因表达的不精确性造成。通过在原位替换株JKL中强化表达CoQ生物合成途径相关基因ubiA、ubiC、ispA、dxs和ddsA，发现CoQ合成总量和CoQ10的比重都有一定程度的提高，其中pLD2-ubiCA(Z)F/JKL最为显著，CoQ总量相比对照JKL提高了239％，CoQ10的绝对产量提高了367％，且CoQ10的产量达到了CoQ8的2.5倍。
ubiA基因编码4-羟苯甲酸转移酶，是大肠杆菌CoQ生物合成途径的限速酶。通过荧光定量PCR技术比较了ubiA基因在不同菌株中的转录水平，结果显示导入含ubiA基因表达质粒的菌株，其转录水平有显著提高，pLD2-ubiCA(Z)F/JKL中ubiA基因的相对拷贝数是JKL的124.8倍，说明强化表达的ubiA基因进行了正常的转录。同时检测了pLD2-ubiCA(Z)F/JKL系统中ubiA基因表达的时间性，发现其在翻瓶10h后转录达到峰值，为4h的5.51倍，与CoQ合成的时间性一致。此外，通过对pLD2-ubiCA(Z)F/JKL系统中其他CoQ合成相关基因转录水平的检测，表明ubiA基因的强化表达对它们的表达影响甚小，并未扰动整个代谢途径。为今后开展UbiA酶动力学、催化特性及酶体外改造等多方面研究的需要，选择了ubiA基因的表达质粒pCA，尝试了UbiA蛋白的初步纯化。