本研究利用了形态学标记和RAPD标记方法对22份有代表性的薄皮甜瓜种质资源进行了遗传多样性的研究，结果如下： 通过系统观察22份种质的植物学和生物学性状，筛选出5份有特殊利用价值的种质材料。用表现型性状标准差标准化的方法，利用SPSS软件，以Num13为阈值，将上述种质分为5类，绘制了亲缘关系聚类图，图中没有体现传统分类系统中的绵瓜品种群。 利用改良的SDS法提取DNA效果良好。RAPD反应时，DNA模板中RNA对扩增结果无影响；蛋白质、多糖等大分子及SDS、氯仿、异丙醇等小分子对扩增结果有干扰作用；模板DNA适宜浓度较宽；优化的RADP条件为：20ul体系含dNTP 200mmol/L，Taq酶1U，缓冲液2ul，模板50ng，超纯水13.5ul，随机引物5pmol。反应程序：96℃预变性5min，加入Taq酶，而后进行扩增，条件为：94℃变性1min，36℃复性1min，72℃延伸2min，共40个循环。 用12个随机引物共扩增126条多态性谱带，由此得到所选22份种质资源遗传距离范围为0.084～0.230，差异较小。用Nei指数法，以遗传相似度0.865为阈值，将其分为6类。结果与形态学标记结果有差异。