华法林代谢及作用靶点基因甲基化与治疗反应性的关联性研究

来源 :厦门大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lichiuyun13
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景华法林因为抗凝效果好、价格低廉,所以广泛应用于房颤等疾病抗凝治疗中。然而,华法林存在治疗窗口窄、个体间剂量差异大等问题限制了其临床应用,并引发了潜在公共卫生问题。在新型口服抗凝药无法替代华法林的情况下,需要寻找更合适的生物标志物来提升现有剂量预测模型的准确性。目前研究认为DNA甲基化有作为生物标志物用于药物剂量预测的潜力。因此,我们假设DNA甲基化有作为生物标志物用于预测华法林用药剂量的可能性。研究目标本研究对中国应用华法林的人群中以下研究目标进行探究:首先,探索全基因组范围内DNA甲基化与华法林不同治疗反应性之间的关联;其次,明确单核苷酸水平的CpG位点甲基化与华法林不同治疗反应性之间关联的可靠性;最后,尝试分析目标CpG位点甲基化水平与华法林治疗反应之间关联的机制。研究方法本研究建立在课题组前期基础上,通过两阶段研究方法进行本研究。在第一阶段,我们通过人工匹配筛选出30例研究对象的Illumina Infinium Human Methylation 450 K Bead Chip微阵列芯片原始数据,使用GenomeStudio软件和R软件对其进行清洗,校正和差异分析,随后通过富集分析和系统评价筛选出与华法林治疗反应性相关潜在CpG位点。在第二阶段,设计和建立焦磷酸测序引物和检测方法,对挑选得到131例研究对象中第一阶段研究筛选得到的差异CpG位点及周围CpG位点(共16个)甲基化水平进行定量检测,随后通过R软件进行不同治疗反应性组间的差异分析和关联分析。此外,通过系统评价的方法找寻并借鉴前人研究,用于分析本研究结果并提出机制假说。研究结果1.通过芯片检测了 473920个CpG位点甲基化水平,随后全基因组DNA甲基化差异分析得到了三个比较对之间差异CpG位点(敏感-耐受:42549个;正常-耐受:26076个;敏感-正常:3955个)。2.差异CpG位点主要富集于生物调控、蛋白质结合、细胞膜组成等生物功能通路上,其中,位于华法林相关通路蛋白编码基因上差异C pG位点共5个。3.CYP1A1基因启动子区域上外源物反应元件(xenobiotic response element,XRE)周围多个CpG位点甲基化水平与华法林不同治疗反应性(敏感、正常和耐受)之间存在显著正相关(r>0,P<0.05)。对于这一关联,通过参考既往烟草烟雾暴露导致人CYP1A1基因启动子区域甲基化改变的研究提出了新的假说通路。4.VKORC1启动子上一个CpG位点(chr16:31106793)甲基化水平与华法林不同治疗反应性(敏感、正常和耐受)之间显示出显著负相关(r<0,P<0.05)。结论1.全基因组范围内差异CpG位点甲基化水平可能通过影响生物调控、蛋白质结合、生物膜等功能进而干扰华法林代谢和作用靶点等功能。2.首次发现CYP1A1基因启动子区域CpG岛上XRE区域多个CpG位点甲基化水平与华法林治疗反应性分组间呈现显著正相关。3.新发现VKORC1基因启动子区域的CpG位点(chr16:31106793)甲基化水平和不同华法林治疗反应性分组间呈现显著负相关。4.本研究的研究成果可以为未来大型队列研究提供支持和补充,也为华法林生物标志物、耐药机制等提供新研究思路。
其他文献
河口区域是海洋开发的前沿地带,是陆地与海洋物质流和能量流交换的重要平台,也是人类活动密集的区域,因此河口区域的环境问题是目前河口研究的热门方向。河口区域面临的主要环境问题为入海泥沙量锐减、陆源污染物增加、湿地被侵占、水温异常等,对这些环境问题进行评估需要对水域的温流分布以及径流通量进行高精度的实时监测。然而河口区域的温流分布受到径流以及潮汐的双重作用,呈现明显的空间差异性,因此在实时监测上存在一定
交通运输工具的发展是保证国民经济增长的决定性因素之一。当前,代表中国最先进的交通运输工具有:轨道交通领域的中国高铁“复兴号”和民用航空领域的现代干线飞机C919。但在交通运输工具高速发展的同时,因结构导致的交通安全事故时有发生。转向架构架作为高铁等轨道交通车辆的骨架,在行车过程中承受复杂外力作用,故转向架构架,特别是其焊接区域,是轨道交通车辆最常见的失效部件之一。飞机的复合材料结构在飞行中需要承受
沸石是一类具有丰富三维纳米孔道的铝硅酸盐分子筛。MFI型结构是众多沸石分子筛拓扑结构中的一种,该结构具有独特的“之”字型与直线型十元环纳米孔道。ZSM-5铝硅酸盐沸石分子筛和其全硅端元的Silicalite-1沸石分子筛是MFI型沸石分子筛的典型代表。MFI型沸石分子筛因其优异的择形催化性、良好的吸附分离性、较高的热稳定性成为能源与环保领域最为重要和常用的沸石分子筛种类之一。然而,MFI型沸石分子
21世纪以来,海洋在一个国家中的地位,特别是军事的战略地位变得越来越突出。在开发和利用海洋资源的过程中,为了维护这个过程中的安全,无论是民用还是军用,都要正确地对水声目标进行分类识别和跟踪。为了更好地监控特定海域,也需要对该海域中的水声目标进行分类和识别。因此本文在水声识别技术的基础上,以船舶辐射噪声为主要研究对象,研究不同种类船舶的识别问题。虽然水声目标识别技术已经发展了很多年,但是在大多数情况
肝细胞癌(HCC)是原发性肝癌中最常见的病理类型同时也是全球第四大癌症相关死亡原因。它属于高度炎症相关的癌症类型,调节性细胞死亡(RCD)可在HCC的“炎症-致癌”途径中起到肿瘤抑制的作用。铁死亡是一种新型RCD,可规避致癌过程的抗凋亡信号有利于抑制HCC进展。铁死亡性细胞形态表现为线粒体大小、外膜及嵴的改变,肿瘤抑制因子p53的逆行信号是线粒体早期功能障碍的提示信号,参与细胞生存和死亡之间的调节
随着航空发动机性能的日益提高,对其内部压力进行检测和实时监控成为了人们研究的重点。但由于结构和材料的限制,传统的压力传感器无法在发动机内部高温、高压环境下工作。最近一种基于微波谐振腔的压力传感器因其具有无线无源的结构以及高温下信号传输距离远等优点,特别适合在高温高压的环境下进行压力监控,因此受到广泛关注。聚合物先驱体陶瓷(Polymer-derived ceramics,PDCs)具有高的耐高温性
数字货币作为一款新兴的投资产品,由于其良好的技术应用前景和较高的投资回报率,在交易市场受到追捧。与其他投资产品一样,市场迫切需要一种自动化分析工具去分析数字货币的历史数据,并对数字货币的未来做出预测。机器学习方法在各个领域被广泛使用,数字货币市场也不例外,其中集成学习方法相较于传统机器学习方法具有效率高,性能优异,鲁棒性强等优点,越来越多研究者开始关注如何将集成学习更好的应用于数字货币市场上。在数
碳纳米材料,例如富勒烯、碳纳米管和石墨烯具有轻的质量、独特的结构和令人惊叹的性质,在复合材料、催化、能源、生物医药等多个领域已有或具有潜在应用。然而,原始的富勒烯、碳纳米管和石墨烯等碳纳米材料易团聚、表面疏水,导致它们的分散性较差,限制了应用。而经过修饰或改性的碳纳米材料不仅改善了分散性甚至能发挥出更好的性能。所以,针对碳纳米材料的改性方法探究也是碳材料的性质和应用研究中的一个重要领域。本文的研究
传统化石能源随着人类社会的飞速发展而日渐匮乏,研究新型的绿色发电技术迫在眉睫。此外,随着可穿戴电子设备的快速发展,人们对绿色环保、方便快捷的供电电源的需求也与日俱增。纳米发电机能够收集环境和人体中未被充分利用的机械能并将其转化为电能进而为电子设备供电,已成为近年来的研究热点。本硕士论文基于碳纳米管阵列在电解质溶液中的弯曲发电效应,设计并制备了基于碳纳米管阵列的流体纳米发电机,研究了其发电性能与发电
目的:1.构建基于案例的混合式教学模式。2.评价基于案例的混合式教学在《老年护理学》课程中的应用效果。方法:本研究分为两个部分。第一部分,通过开展文献研究,头脑风暴法以及专家小组会议法,构建包括“课前、课中、课后”三阶段,涵盖线上线下的基于案例的混合式教学模式;第二部分为实证研究阶段,选择福建省某高等院校护理专业大学三年级学生277名作为研究对象,开展《老年护理学》教学,对照组采用传统案例教学,试