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乳腺癌是内在因素和环境因素、内外交困导致的一类复杂疾病,理解其发生与发展的分子生物学背景,对于诊断、干预、预后评价以及未来精准治疗都有非常重要的意义和价值。既往研究,发现乳腺癌患者和正常对照体内BRWD3(bromodomain and WD repeat domain containing 3)表达差异存在统计学意义的显著性,但在乳腺癌组织中表达和作用特点不明。BRWD3是包含bromodomain结构域蛋白家族成员之一,该家族成员编码基因突变或者表达异常与慢性白血病、黑色素瘤、头颈癌等多种肿瘤以及精神和神经类疾病相关。本研究首先利用生物信息学手段分析TCGA database中数据,探究BRWD3在乳腺癌进展中作用的线索;利用免疫组化手段结合生物信息学结果,分析该分子在乳腺癌组织中表达特点、与临床特征之间的相关性以及其在进展中的作用。第一部分:乳腺癌组织中BRWD3基因突变状况分析在cBioPortal for cancer genomeics平台,分析乳腺癌组织中BRWD3突变。利用SIFT和Polyphen-2评估突变危害。结果显示:在2项乳腺癌研究项目、11例正常乳腺组织中,未发现BRWD3突变;在10例良性乳房叶状肿瘤中,未发现BRWD3突变;在13项浸润性乳腺癌研究中,7271个患者7438个样本中,检索到34个患者存在BRWD3(NM_153252)突变。对突变类型进行危害评估,37个突变类型中,SIFT评估有害突变有20个错义突变类型;Polyphen-2评估有害突变有19个错义突变类型。然而,功能缺失性截短突变却未被评为有害突变。对这些BRWD3有害突变类型进行临床特征关联分析,因缺乏Ki-67的值,只能初步估计可能属于luminal型(4例),HER2过表达型(1例),疑似三阴性(1例),2例不明。第二部分:BRWD3表达水平与乳腺癌发生、发展之间相关性使用GDC-client下载临床资料和分子生物学信息。根据临床资料筛选病理类型为浸润性导管癌(Invasive Ductal Carcinoma,IDC)和浸润性小叶癌(Invasive Lobular Carcinoma,ILC)的RNA-seq数据,构建表达矩阵,根据病理类型赋值构建分组矩阵。用edge R语言包,进行差异表达分析。选择前30000个差异表达基因,将符合2个常用标准的|㏒2FC|>1,且p<0.05的基因归纳为csv文件。利用独立样本T检验,检测两组间表达差异,单因素方差分析方法检测多组间表达差异,p<0.05被设定为差异具有统计学意义的显著性。结果显示:癌组织相对于癌旁组织,BRWD3表达水平升高,差异具有统计学意义的显著性(p<0.05)。BRWD3在浸润性导管癌中表达高于浸润性小叶癌,差异具有统计学意义的显著性(p<0.001)。第三部分:BRWD3在乳腺癌组织中表达特点在临床上收集了1例乳腺增生症、9例乳腺纤维腺瘤、32例乳腺癌组织标本。采用苏木素伊红染色和免疫组化法,观察BRWD3在乳腺癌组织中表达特点。首先,优化和标准化免疫组化参数;随后,检测BRWD3在组织中的表达。最后,经3位以上高级病理医师对切片进行阅片、诊断和阳性程度评估,结果显示:BRWD3在该例乳腺增生症中检测为阴性;在41例纤维腺瘤和乳腺癌组织中,仅1例癌组织中为阴性,其余呈现胞浆、胞膜和胞核分布差异的异质性。第四部分:BRWD3在乳腺癌进展中的作用采用生物信息学手段,分析BRWD3是如何影响IDC和ILC这两种乳腺癌进程。结果显示:对IDC和ILC基因差异表达进行分析,共获得1486个差异表达基因,富集于细胞分裂、细胞骨架和炎症反应方面。对标准差(Standard Deviation,SD)大于1.0的基因进行共表达分析,发现BRWD3所在模块与IDC/ILC病理学类型形成相关。对BRWD3所在模块基因进行分子互作分析,164个基因形成互作网络,生物学过程功能富集于上皮细胞迁移的调控、含氮化合物代谢调控、细胞粘附以及细胞通讯方面。第五部分:BRWD3表达与ER、PR和HER2标记之间相关性将BRWD3在乳腺癌中表达水平,按照均值分为高表达组和低表达组,分析这两组中ER、PR和HER2蛋白质表达和状态差异,寻找BRWD3与病理学类型之间关系。结果显示:BRWD3转录水平高低与PR状态(p=0.032)、与HER2蛋白表达水平(p=0.0030)、HER-2/3不同位点磷酸化蛋白(HER2_p Y1248和HER3_p Y1289)水平方面存在显著的相关性,BRWD3转录水平与ER状态以及ER蛋白表达水平不存在统计学意义的相关性。采用免疫组化手段,检测BRWD3与PR、HER2之间关系。结果显示:BRWD3与PR状态存在正相关、PR和HER2表达存在负相关的趋势。结论:BRWD3在癌与癌旁组织、IDC和ILC之间存在表达差异;BRWD3在癌组织中的表达与PR存在正相关趋势,与HER2可能存在负相关趋势,BRWD3在ER阴性与ER阳性患者中的表达差异不具有统计学意义的显著性,BRWD3高表达患者组的ER蛋白表达水平与BRWD3低表达组的也不具有统计学意义的显著性;WGCNA结果结合既往研究,BRWD3可能影响细胞骨架组装、细胞粘附、细胞社会联系等重要的细胞学事件,影响IDC和ILC形成和PR/HER2相关临床特征形成,影响乳腺癌整体进程。