细菌中乙偶姻代谢相关研究

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本论文对乙偶姻在细菌体内的分解代谢相关的未知蛋白AcoX进行了NCBI序列比对,对其性质及功能进行了预测,并以Pseudomonas putida KT2440的基因组为模板,克隆表达了acoX基因,并对纯化后的AcoX进行了圆二色谱分析。NCBI中将AcoX注释为NADK,NADK家族的氨基酸序列上有两段高度保守的序列:GGDG模序和Gly-rich模序。但通过对九个物种的典型的AcoX氨基酸序列比对发现,它仅有保守的GGDG模序以及自己独特的保守序列,而没有Gly-rich模序。因此认为AcoX不是NADK,并进一步用实验进行了证明。以P. putida KT2440的基因组为模板,根据其acoX序列设计引物,克隆表达acoX基因,并用镍螯合亲和层析法对AcoX进行了纯化,得到的纯化蛋白用圆二色谱对其二级结构进行分析,分析结果表明,AcoX为α螺旋和β折叠混合型。本论文还以Bacillus subtilis 168的基因组为模板,根据其acoA序列设计引物,进行PCR扩增,克隆表达了acoA基因,并对其进行纯化,用纯化后的蛋白进行了E1的酶活验证,实验没有检测到酶活,暗示了E1是由E1α亚基和E1β亚基共同编码的,β亚基对E1的正确折叠起到不可替代的作用。另外,本论文还以葡萄糖为底物,用气相色谱检测产物,实验表明,在葡萄糖发酵过程中,首先产生乙偶姻,然后会有少量的2,3-丁二醇产生,但在较短的时间内,2,3-丁二醇产生后又首先被耗尽,实验研究了发酵产物的产生与底物的消耗及菌体生长的关系。
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