上世纪80年代末，大亚湾海域水质良好，分布有丰富的水产资源。进入90年代以来，多个大型建设开发项目在大亚湾兴建，拉动了当地经济的发展，但同时又对该区域的环境产生了一定的压力。在这个过程中，大亚湾水体逐渐由原先的贫营养状况转化为中营养状况，浮游植物和浮游动物的数量和种群结构也发生了相应的变化，并进一步通过食物网的作用对其他海洋生物产生影响。 本研究以1987年的大亚湾海域生态系统作为研究对象，运用Ecopath withEcosim建立生态模型，量化分析系统中的能量流动和营养关系，并在此基础上，运用Ecosim模块和Ecotracer模块动态模拟了系统在时间上的变化。该研究通过建立模型的方式量化了大亚湾海域生态环境的变化，具有一定的现实意义和创新性，对EwE模型往后在我国的推广应用和海洋生态环境的科学管理都具有重要的作用。 研究的主要内容和结论如下： (1)建立了由16个生物功能组所构成的Ecopath生态模型，经调试后达到平衡，计算得出，功能组的有效营养级所属范围为1.00～4.07； (2)通过基本分析和网络分析发现，系统中存在分别以浮游植物、大型底栖植物和有机碎屑为起点的三条主要食物链，系统中的能量流动贯穿了营养级Ⅰ～Ⅶ，但相对其他生态系统而言，该系统中各营养级的的能量转化效率偏低，表征系统总体特征的多项指数也证明了该系统正处于不成熟的状态； (3)运用Ecosim模块模拟了1987～1998年间系统在营养状况和浮游生物生物量改变的条件下的动态变化，结果显示，在水体富营养化的进程中，多数生物资源量也随之增长，当中底栖生物食性鱼类和游泳动物食性鱼类的增长速度高于浮游牛物食性鱼类，相对浮游植物来说，浮游动物的牛物量变化对多数生物的影响更为显著，另外，同为饵料生物的功能组之间对营养存在竞争的关系； (4)运用Ecotracer模块动态模拟了1987～1998年间重金属Cd在系统中各种生物体内的含量变化，结果显示，几种主要生物体内重金属Cd含量的大小关系是——海洋哺乳动物>软体动物>浮游生物食性鱼类>头足类动物>甲壳动物(蟹类和虾类)>其他食性鱼类(底栖生物食性、游泳动物食性和杂食性鱼类)，这些生物虽未受到重金属Cd的严重污染，但部分生物在模拟的某些时间段内已存在食用安全卫生的问题。