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目的:
筛选并验证食管鳞癌患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中异常表达的lncRNAs,结合患者临床资料,通过对食管鳞癌各临床病理特征与差异lncRNAs表达水平与之间的关系进行统计学分析,为食管鳞癌的诊断提供潜在的无创性生物分子检测指标,并为治疗提供新的候选作用靶点。
方法:
1选取正常体检者和经手术后病理确诊、未经放疗和化疗的食管鳞癌患者各5例,提取外周血单个核细胞,进行RNA测序,通过生物信息学分析筛选出差异表达的lncRNAs,确定差异最显著的SNHG3和SNHG20作为后续研究对象。
2后期选取40名未经放化疗的食管鳞癌患者和30名正常体检者对SNHG3和SNHG20在食管鳞癌患者和正常体检者PBMC中的差异表达现象用qRT-PCR进行验证。
3由医院信息系统(hospital information system,HIS)获取患者临床病理特征,将其与SNHG3和SNHG20的相对表达量之间的关系利用SPSS和GraphPad统计软件进行统计学分析,找寻规律。
结果:
1.与正常体检者PBMC相对比,本研究在食管鳞癌患者PBMC中共鉴定出158个差异表达的lncRNAs(differentia expression lncRNA,DEL )(54个上调和104个下调),P<0.05。158个差异lncRNAs广泛参与多种疾病和各种信号通路。在所有DELs中,下调最明显的是SNHG20和SNHG3,位居前两位,P<0.001。
2.40例食管鳞癌患者PBMC中SNHG3的相对表达量为0.587±0.870,正常体检者PBMC中SNHG3为2.520±2.112,前者明显低于后者,其差异具有统计学意义(t=4.723,P<0.001);SNHG20在ESCC患者PBMC中的相对表达量为0.907±1.688,明显低于正常体检者的2.550±2.590,差异具有统计学意义(t=3.025,P<0.001)。
3对SNHG3和SNHG20相对表达水平的变化与ESCC临床病理特征的关系进行统计学分析,发现PBMC中SNHG3和SNHG20对ESCC的影响不尽相同。SNHG3在PBMC中的表达下调程度与肿瘤的大小、淋巴结浸润、是否远端转移和TNM分期存在密切联系,组间差异具有统计学意义,P<0.05;但是不同的病人年龄、性别及肿瘤分化程度之间,PBMC中SNHG3的表达差异没有统计学意义。
SNHG20在PBMC中表达水平的降低与ESCC的分化程度、淋巴结浸润、是否远端转移和TNM分期关系密切,组间差异具有统计学意义,P<0.05;而不同的性别、年龄和肿瘤大小之间的变化无统计学意义。
结论:
食管鳞癌患者PBMC中SNHG3和SNHG20表达量明显低于正常体检者,且进一步的分析表明ESCC患者PBMC中SNHG3和SNHG20的异常表达变化分别与食管鳞癌的某些临床病理特征关系密切,提示我们SNHG3和SNHG20有望成为食管鳞癌新的无创性检测标志物和潜在的治疗靶点。
筛选并验证食管鳞癌患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中异常表达的lncRNAs,结合患者临床资料,通过对食管鳞癌各临床病理特征与差异lncRNAs表达水平与之间的关系进行统计学分析,为食管鳞癌的诊断提供潜在的无创性生物分子检测指标,并为治疗提供新的候选作用靶点。
方法:
1选取正常体检者和经手术后病理确诊、未经放疗和化疗的食管鳞癌患者各5例,提取外周血单个核细胞,进行RNA测序,通过生物信息学分析筛选出差异表达的lncRNAs,确定差异最显著的SNHG3和SNHG20作为后续研究对象。
2后期选取40名未经放化疗的食管鳞癌患者和30名正常体检者对SNHG3和SNHG20在食管鳞癌患者和正常体检者PBMC中的差异表达现象用qRT-PCR进行验证。
3由医院信息系统(hospital information system,HIS)获取患者临床病理特征,将其与SNHG3和SNHG20的相对表达量之间的关系利用SPSS和GraphPad统计软件进行统计学分析,找寻规律。
结果:
1.与正常体检者PBMC相对比,本研究在食管鳞癌患者PBMC中共鉴定出158个差异表达的lncRNAs(differentia expression lncRNA,DEL )(54个上调和104个下调),P<0.05。158个差异lncRNAs广泛参与多种疾病和各种信号通路。在所有DELs中,下调最明显的是SNHG20和SNHG3,位居前两位,P<0.001。
2.40例食管鳞癌患者PBMC中SNHG3的相对表达量为0.587±0.870,正常体检者PBMC中SNHG3为2.520±2.112,前者明显低于后者,其差异具有统计学意义(t=4.723,P<0.001);SNHG20在ESCC患者PBMC中的相对表达量为0.907±1.688,明显低于正常体检者的2.550±2.590,差异具有统计学意义(t=3.025,P<0.001)。
3对SNHG3和SNHG20相对表达水平的变化与ESCC临床病理特征的关系进行统计学分析,发现PBMC中SNHG3和SNHG20对ESCC的影响不尽相同。SNHG3在PBMC中的表达下调程度与肿瘤的大小、淋巴结浸润、是否远端转移和TNM分期存在密切联系,组间差异具有统计学意义,P<0.05;但是不同的病人年龄、性别及肿瘤分化程度之间,PBMC中SNHG3的表达差异没有统计学意义。
SNHG20在PBMC中表达水平的降低与ESCC的分化程度、淋巴结浸润、是否远端转移和TNM分期关系密切,组间差异具有统计学意义,P<0.05;而不同的性别、年龄和肿瘤大小之间的变化无统计学意义。
结论:
食管鳞癌患者PBMC中SNHG3和SNHG20表达量明显低于正常体检者,且进一步的分析表明ESCC患者PBMC中SNHG3和SNHG20的异常表达变化分别与食管鳞癌的某些临床病理特征关系密切,提示我们SNHG3和SNHG20有望成为食管鳞癌新的无创性检测标志物和潜在的治疗靶点。