ABEEMσπ/MM模型下8种类型氢键的氢键拟合函数

来源 :辽宁师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:loganmax
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
氢键在生命活动中扮演着重要角色。生命体系是一个水溶液体系,研究生物分子与水分子间的氢键是十分必要的。在ABEEMσπ/MM浮动电荷模型下,为了防止电荷过度极化,提高力场的准确性,我们引入了氢键拟合函数klp,H(Rlp,H)在氢键相互作用区域代替总校正系数k来描述氢键相互作用。本文选取了8个模型小分子二聚体,通过拟合在氢键两个区域之间不同距离时从头计算方法下的结合能,来拟合ABEEMσπ/MM方法下的氢键拟合函数。应用该氢键拟合函数在ABEEMσπ/MM方法下计算小分子二聚体的结合能,与从头算方法得到的结合能有很好的一致性。与此同时,将在ABEEMσπ/MM方法下优化的小分子二聚体的氢键键长与键角与从头算结果进行了比较,以进一步检验所拟合的氢键拟合函数的适用性。键长与键角的均方根偏差均在合理范围内。为说明这些函数具有良好的可转移性,本文还对具有同样类型氢键的其他二聚体的结合能、氢键键长和键角进行了计算,所得结果与从头算结果相差不大。对于每一种类型的氢键,都有其相对应的一套氢键拟合函数的参数。为使一套氢键拟合函数的参数能够计算几种类型的氢键,本文对这些参数进行调整,得到简化的氢键拟合函数的参数。在ABEEMσπ/MM模型下,应用简化的氢键拟合函数对二聚体进行优化与计算。二聚体的结合能与从头算结果相近,优化构型中的氢键键长与键角与从头算结果同样符合良好。因此,简化的氢键拟合函数具有良好的适用性。
其他文献
改革开放以来,我国职业教育为各地经济建设培养了大批专门人才,基本满足了经济发展对技能人才的需求。同时,我国职业教育也面临着社会变革和经济转型带来的一系列挑战。为此,
本论文合成了未见报道过的14种基于(4-羧基苯基)(4-(2-羧基苯基)苄基)醚(H2L)和3种含氮中性配体(biim-4=1,4-二(1-咪唑基)丁烷、BIE=2,2’-二(1-咪唑基)乙醚和phen=1,10-二氮杂菲)的新型配
如何有效提升初中语文教学的有效性是语文教育工作者一直探讨的课题。本文从有效教学的内涵和特征出发,分析了有效教学的必要性,在此基础上重点介绍了提高初中语文课堂教学有效
钒及其氧化物在工业催化及航空航天等很多领域都有重要的应用背景。为了优化钒相关材料的生产和加工工艺,提高钒氧化物的催化效率,需要通过获取更多的钒氧化物分子跃迁谱线信息
债或合同的相对性是自罗马法以来的一项重要原则,但随着社会经济的发展,为了满足社会利益、实现司法公正的需要,各种突破债的相对性的法律制度纷纷出现,但尚不足以动摇债的相
本论文合成了一种二元有机羧酸3-羧基-1-(4-羧基苄基)-2-氧化吡啶(H2L)及以其作为配体的10种配位聚合物:[Zn(L)(H2O)](1)、[Zn(L)(biim-4)0.5]2H2O (2)、[Zn(L)(biim-6)0.5]2H2O (3)、[Zn(L)(BTE)0.5(H2O)]
<正> 在十八世纪以前,人们并末觉察到哈姆雷特的性格中有什么矛盾和模糊不清的地方。在观众的心目中,哈姆雷特就是一个单纯的复仇者,莎士比亚的悲剧如同当时其它流血悲剧一样
<正> 五·四时期文坛呈全方位开放的态势,唯美主义作为“新浪漫主义”的一支,也被许多人视为最新文学潮流之一。欧洲唯美主义,尤其是其主要代表、英国作家王尔德,是中国最早
<正>糖尿病的健康教育被誉为治疗教育,它除了能帮助建立良好的心理状态和生活方式外,还能使患者了解相关知识、掌握控制糖尿病的基本技能,从而使患者参与治疗,达到控制血糖,
酶作为一种重要的生物催化剂,在生命、医药、食品等很多领域有重要应用。电泳媒介微分析(ElctrophoreticallyMediatedMicroAnalysis,EMMA)技术在酶分析研究中具有独特的优点而受