工具酶辅助信号放大的DNA电化学传感器

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:glsdap
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
基因检测在疾病早期诊断、预后评估及药物治疗指导等方面具有重要意义,因而在临床医学方面具有举足轻重的地位。为了提高临床医疗效率和降低医疗成本,使医学服务于广大人民群众,未来的基因检测将朝着床边诊断系统发展。DNA电化学传感器具有易于微型化、快速、高通量、高灵敏度、高特异性和价格低廉等优点,因而具有广阔的临床应用前景。
  为了实现实际样品中核酸的痕量分析,通过信号放大途径提高灵敏度尤为重要。基于分子生物学中工具酶的高催化能力、高生物相容性、高特异性和高灵活性等特征,本论文利用工具酶通过引入多个信号分子或使目标链放大等方式构建简单、超灵敏的DNA电化学传感器,实现了对复杂实际样品的检测,为DNA电化学传感器广泛应用于临床奠定扎实的基础,本论文主要研究工作如下:
  (1)在第一部分中,利用末端脱氧核苷酸转移酶(terminal deoxyribonucleotide transferase,TdT)在恒温条件下无需模板即可催化多个脱氧核糖核苷三磷酸(dNTP)聚合到DNA分子的3’羟基末端的特点,构建了植入模式(grafting-to mode)的DNA电化学传感器。与传统的TdT介导的基于界面起始聚合(surface-initiated enzymatic polymerization,SIEP)模式的电化学传感器不同,本实验采用先均相延伸后固相杂交的方法引入多个信号分子。实验结果表明,SIEP模式所存在的高背景问题是由于TdT在界面作用时所产生,而并非是由探针的非特异性吸附所引起。然而,植入模式可以避免高背景的产生,使用较高的酶量即可快速的完成反应,所需反应时间从120min降至20min。通过对检测性能多方面的比较,植入模式在背景、时间、电流值等方面均显著优于SIEP模式。
  (2)在第二部分中,基于连接酶链式反应(ligation chain reaction,LCR)提出了一种简便、实用的双链组装型DNA电化学传感器。通过均相LCR扩增得到大量两端分别修饰有巯基和生物素的短双链DNA(dsDNA)片段,具有刚性结构的dsDNA通过金-硫键均匀的分布在牛血清白蛋白(bovine serum albumin,BSA)组装界面上,而末端生物素通过与链霉亲和素的特异性结合将HRP固定到金电极表面,最后通过辣根过氧化物酶(horeseradish peroxidase,HRP)催化TMB-H2O2底物进行电化学检测。结果表明,在目标DNA浓度为1.0×10-16~1.0×10-11M时,安培电流与和浓度对数值呈良好的线性关系,检测限为5.0×10-19M(50μL的反应体系里含有15个目标DNA分子)。此外,该方法能够显著区分其他三种碱基所引起的单碱基错配,可用于单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的分析。在实际样品应用中,该方法可直接从血清总核酸提取物(DNA/RNA)里的大量基因组和长短不一的RNA中检测出不同含量的C型乙型肝炎病毒(HBV)基因组,而对于B型样品和正常样品则没有响应,显示出很好的检测效果,且与基因测序和凝胶电泳结果相符。更为重要的是,通过改变引物序列可以检测不同的目标DNA序列,因此本方法具有通用性,有望用于临床各种疾病相关DNA标志物的定性定量分析。
  (3)本文第三部分在第二部分的基础上提出亲和素标记的多聚辣根过氧化物酶(SA-PolyHRP)与LCR双重信号放大用于急性早幼粒细胞白血病(acute promyelocytic leukemia,APL)PML/RARα融合基因检测的电化学生物传感器,即将均匀分布在电极表面的经LCR扩增的每条短双链DNA末端结合多个HRP从而实现后放大(post-amplification)。选择酶联免疫分析中以不同方式引入多个HRP的链霉亲和素-酶标生物素复合物和链霉亲和素包被的HRP聚合物这两种酶复合物进行实验,结果表明链霉亲和素包被的HRP聚合物由于其外部的链霉亲和素层更易与电极表面的生物素结合而产生有效信号放大。针对固定局限在融合位点附近PML/RARα融合基因所设计的探针,本实验在引入SA-PolyHRP之后保证了灵敏度,可检测低至15个拷贝的目标DNA分子,在1.0×10-16M到1.0×10-13M浓度范围内,安培电流与浓度的对数值呈线性关系,与传统的SA-HRP相比,其在灵敏度上提高近2个数量级。此外,在引入SA-PolyHRP之后,本方法同样具有较高的特异性,能够显著区分其他三种碱基所引起的单碱基错配,而且本实验所设计的PML/RARα融合基因探针区分单碱基错配的能力更加显著。
其他文献
随着微电子技术的不断发展,电子器件逐步走向小型化、高速化和高储能化,要求电介质材料兼顾加工性能和介电性能。而单一高分子或无机材料无法兼顾介电性能和力学性能,因此制备陶瓷/聚合物复合材料是解决这一问题的有效途径。  CaCU3Ti4O12(CCTO)陶瓷具有超高的介电常数(在室温下,频率为1kHz时可高达10000)、电流电压非线性效应、良好的温度稳定性以及显著的介电可调性等独特性能,使其成为一种优
学位
[db:内容简介]
当今世界互联网技术快速发展,它的传播呈现出飞速化、圈层化、广泛化等特征,这使得政府对于信息传播的引导工作提出了更高的要求。以新媒体为代表的互联网信息传播方式在带了极大便利的同时,也客观上放大了“谣言”所造成的危害。正因为政府公共危机事件有着突发性、不可控性和高度的社会关注性,所以它们成为民众关注的热点和焦点。政府公共危机事件发生后,新媒体虽然主动承担了信息传播的主要途径,但是新媒体对于信息的快速、
Background Early loading statin therapy before percutaneous coronary intervention is associated with reduced mortality and periprocedural myocardial injury. We studied the effect of rosuvastatin loadi
学位
会议
~~
目的:  通过运用养血化痰法治疗室性早搏,评估其治疗前后临床疗效和安全性,为养血化痰法治疗室性早搏提供依据。  方法:  前瞻性随机对照研究,纳入已确诊为室性早搏的患者63例,采用简单随机化方法分为两组,治疗组口服养血化痰颗粒剂。对照组常规口服酒石酸美托洛尔片(倍他乐克)。治疗4周后,观察治疗前后24h动态心电图室性早搏变化情况、中医证候疗效、心率、血压、血常规、二便常规、肝功能、肾功能、离子等指
学位
“现代性”在漫长的时间里一直是电影所探讨的焦点之一。现代性具有宽泛的定义,它可以是理性主义的精神,可以是俯瞰社会荣光和阴暗的宏大叙事,也可以是工业文明的缩略语,是现代政治经济的代名词。然而,随着社会的进步和发展,“现代性”的内涵开始僵化,“独立自主”的精神走向人类中心主义,“理性批判”限制了生而为人的想象自由。此时,“后现代”于“现代”中脱身而出,质疑一切、解构一切,带给人们更多关于自我与社会的思
金纳米团簇是一类重要的荧光纳米材料,具有突出的光致化学发光、电学、磁学、催化等性能,在生物成像、生物活性小分子检测、纳米生物传感器等领域有着广泛的应用。金纳米团簇一般仅由几个到几百个金原子组成,直径通常小于2nm。近年来,对金纳米团簇的荧光性质已经有了诸多的研究报道,并且对它的制备方法也已取得了一定的进展,但是关于高水溶性高荧光量子产率的金纳米团簇的制备仍然是一个难题。此外,人们对金纳米团簇合成机