近年来,中央政府多次重大会议及其出台的文件反复强调了区域协调发展这样一个重要任务。正是在此背景下,作为区域协调发展重要体现的成渝地区双城经济圈建设的战略任务应运而生。同时,川渝协同发展也上升成为国家层面的重要发展战略。随后,在国家战略考量的指引下,两地响应国家号召,迅速展开行动,通过建立联席会议机制、设立联合组织机构、明确合作范围和重点,为相关工作的开展奠定良好基础。然而,也要看到,地方政府合作的成效在一定程度受到了行政区划的影响。在区域性事务治理工作中,地方政府间及相关部门由于缺乏有效的信息和资源整合,轻视整体规划与协作,较少与其他地区、部门等协作,既降低了治理成本又影响了治理效能。因此,为了更好地实现川渝两地协同发展,缓解行政壁垒所带来的刚性约束,助推成渝协同发展,需要进一步加强地方政府合作与对接。川渝跨界河流污染协同治理是成渝地区双城经济圈建设战略在生态领域的具体体现,是把协同治理作为区域协调发展基本形式在实践中的具体运用。本文以川渝跨界河流污染治理为分析实例,采用了文献研究法、案例分析法,力图探索这样一些问题:川渝跨界河流污染联合共治过程中地方政府合作的现状与成效如何?在两地协同治理方面组织结构、体制机制等方面存在什么不足及其生成原因?应该如何完善与优化相关结构、体制机制等,以构建“川渝跨界联合共治模式”?基于上述问题关切,本文以川渝跨界河流污染防治为主线,围绕问题提出、组织架构、制度建设、资源整合、协同机制等维度展开论述。第一部分主要介绍了本研究的背景、意义,国内外有关跨域公共治理及流域治理等相关学术成果的综述,研究的基本思路和方法、以及重难点等;第二部分是对本文所采用的理论基础进行系统阐述,着重对整体性治理理论与跨域治理府际合作作了一个耦合度分析,通过整体性治理在跨域公共治理地方政府合作中起到的互补、成本效应来破解囿于行政区划刚性约束的府际合作治理碎片化困境;第三部分是对川渝跨界河流污染治理府际合作的基本现状进行考辨,同时对地方政府间合作治理的成效与不足进行辨析,确定当前川渝生态环境共治进程中府际合作治理所存在的制约因素,及应该采用的具体措施和重点改革部分;第四部分是跨域公共治理府际间“整体性治理”模式的建构路径。根据整体性治理的分析范式,构建更具科学性和可行性的治理机制,系统总结川渝两地协同发展进程中地方行政主体之间的合作机制和运作过程,参照理论模型审视以川渝跨界河流污染治理府际合作所暴露的短板和弱项,建立具有中国特色且行之有效的跨域公共事务“整体性治理”体制机制。