CASK和PTEN基因在非小细胞肺癌中的表达研究

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背景与目的非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)是目前全世界最常见的一种恶性肿瘤,但其发病遗传机制仍不明确。本研究拟运用生物信息学技术联合分子生物学技术,为非小细胞肺癌发病遗传机制的阐明及治疗新靶点的发现奠定一定的科学基础。方法运用生物信息学技术(基因组富集分析,gene set enrichment analysis, GSEA和元分析,meta-analysis)方法,筛选在转录水平上影响非小细胞肺癌发生发展的关键基因和通路。然后运用免疫组化技术对其中重要的预测基因的蛋白表达进行形态学上的验证。结果通过GSEA和meta两种分析方法得出的通路中,重叠性较高的为紧密连接通路(Tight junction pathway)。在紧密连接通路中11个基因具有统计学意义(P<0.05);对这11个基因进行GO基因注解发现CASK和PTEN基因与肿瘤发生发展密切相关。对CASK和PTEN基因在非小细胞肺癌中的蛋白表达进行免疫组化检测,结果提示63例非小细胞肺癌组织中分别检测出CASK蛋白18例(28.57%)阳性表达,明显低于24例良性肺组织中16例(66.67%)阳性表达,差异有统计学意义(贮=10.59,P=0.001),癌组织中PTEN蛋白13例(20.63%)阳性表达,明显低于24例良性肺组织中阳性表达20例(83.33%),差异有统计学意义(χ2=29.02,P=0.000)。结论紧密连接通路,尤其是其通路上的CASK和PTEN基因可能与非小细胞肺癌的发生发展有重要的关系,后续本研究小组将对这两个基因进行生物功能学上的验证。
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