血清反应因子（Serum Response Factor,SRF）是一种高度保守且广泛存在的于多种生物体内的转录调控因子,它与大约1216种长度为10bp左右的DNA段序列结合,也被称为CArG-box,并通过这种结合在时空上的特异性上调控靶基因转录表达水平。血清反应因子最早发现于c-fos原癌基因中,这从某种程度上预测了其在生命科学研究领域将被重视的程度,尤其是它与多种病理学上研究的热点相关,比如癌症、心脏疾病等等。在过去,对于血清反应因子的研究多数是将其与某种疾病或者生命代谢过程进行联系,以期望解答它在该过程中所起到的作用及其活动机理。但是,对于其顺式作用元件,特别是在基因组尺度上,与不同组织表达相联系的研究很少。本文旨在通过利用基于微阵列技术的染色体免疫共沉淀技术得到的高通量数据,对其在整个基因组尺度上做一个总体的描述。并且由于Chip-on-chip数据本身所采用了四种细胞系作为实验材料,在一定程度上为本实验揭示不同细胞系之间转录调控的差异提供了可能。本实验采用ENSEMBL数据库的人类全基因组数据GRCh37作为剪切母体,采用NHGRI发起的ENCODE计划中的GSE8489数据集为Chip-on-chip数据集——位点数据集。运用单突变一致性序列、位置特异性评分矩阵等方法对潜在CArG-box进行搜索,并对其结果进行统计分析。得出如下结论:第一,相同的转录调控因子在不同的组织内,所参与的调控网络和调控强度是不同的;第二,PSSM是用于搜索生物大分子序列上特异性结构的较优方法;第三,真核生物体内的生理生化环境对编码基因的转录是存在着显著的影响的;第四,在合适的生理生化条件下,SRF是可以和简单的A/T重复序列结合的;第五,在不同的细胞系内,SRF以不同多聚体形式发挥作用。