背景胰腺癌在众多类型的肿瘤细胞中的恶性度都位居前列,其恶性程度之高、进展之迅速、预后之差让人谈之色变。且通常诊断的时候已经是晚期或转移期,5年生存率不到6%。在胰腺癌中,上皮-间质转化（Epithelial-Mesenchymal Transition,EMT）在其进展、转移等方面占据重要地位。随着生物信息学技术的发展,结合生物信息分析对肿瘤进行研究的手段越来越成熟。本研究通过结合生物信息分析研究CLK1（CDC-like Kinase 1）在胰腺癌EMT过程中的角色,并使用细胞实验进行验证。方法从GEO数据库（Gene Expression Omnibus）中下载表达谱芯片GSE71989,包含8个正常胰腺组织和14个胰腺肿瘤组织。利用R语言软件中的limma包和impute包筛选出正常胰腺组织与胰腺肿瘤组织的差异表达基因并绘制火山图。利用R语言软件中的pheatmap包将最突出的差异表达基因绘制成热图。利用DAVID数据库（The Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery,DAVID）进行基因本体（Gene Ontology,GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）分析对差异表达基因进行注释,并使用R语言软件中Hmisc包和ggplot2包的绘制成图。为了探讨这些数据之间的相关性,利用STRING数据库构建了蛋白质-蛋白质（Protein-protein Internet,PPI）的交互网络,并使用Cytoscape软件绘制PPI图。利用Cytoscape软件中的cytohubba插件将CLK1与EMT标志性的蛋白输入,得到了CLK1与EMT相关蛋白的互作网络。利用基因过表达（Gene overexpression）和RNA干扰技术（RNA interference）技术建立敲减CLK1和过表达CLK1的胰腺癌细胞,并使用Western blot和实时荧光定量PCR检测敲减CLK1和过表达CLK1的效果。Western blot检测构建好的稳转细胞中EMT标志性的蛋白表达并使用Transwell试验验证侵袭能力。结果共找到774个差异表达基因,其中上调和下调的基因分别有531和243个。这些基因主要富集的生物过程为:细胞外基质的形成、胶原蛋白分解代谢的过程、免疫反应、细胞黏附、肝素结合和胶原蛋白绑定等。涉及信号通路为蛋白质消化吸收、细胞外基质受体相互作用、胰液分泌、补体途径和黏着斑等通路中。在Cytoscape的cytohubba插件中发现CLK1蛋白与EMT过程中多个蛋白有相互作用。敲减CLK1的稳转细胞株中,上皮相关蛋白表达量上升,间质相关蛋白表达量下降,过表达CLK1细胞株则相反。Transwell试验证明敲减CLK1能够使胰腺癌细胞侵袭能力下降,过表达CLK1能够加强胰腺癌细胞的侵袭能力。结论CLK1能够通过改变EMT的过程来调节胰腺癌细胞的侵袭性,或可成为治疗胰腺癌的靶点。