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研究了腈类降解微生物基因最优密码子及其同义密码子相对使用频率，探讨了不同腈类降解微生物最优密码子特定的相似与不同，并借助了统计方法对应分析来探究密码子使用变化的趋势，为使用基因工程手段改进腈类降解微生物降解腈类的效率及腈类微生物品系的识别提供指导和依据。放射性土壤农杆菌K84(Agrobacterium radiobacter K84)染色体1的3744个基因，放射性土壤农杆菌K84(Agrobacterium radiobacter K84)染色体2的2363个基因，根癌土壤农杆菌C58(Agrobacterium tumefaciens str. C58)环状染色体的2765个基因，根癌土壤农杆菌C58(Agrobacterium tumefaciens str. C58)线性染色体的1851个基因，睾丸酮丛毛单胞菌CNB-2(Comamonas testosteroni CNB-2)的4799个基因，Chelativorans sp.BNC1的4064个基因，荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens F113)的5862个基因，荧光假单胞菌Pf-5(Pseudomonas fluorescens Pf-5)的6108个基因，荧光假单胞菌Pf0-1(Pseudomonas fluorescens Pf0-1)的5722个基因，荧光假单胞菌SBW25(Pseudomonas fluorescens SBW25)的5921个基因，恶臭假单胞菌F1(Pseudomonas putida F1)的5250个基因，恶臭假单胞菌GB-1(Pseudomonasputida GB-1)的5408个基因，恶臭假单胞菌KT2440(Pseudomonas putida KT2440)的5350个基因，恶臭假单胞菌S16(Pseudomonas putida S16)的5218个基因，恶臭假单胞菌W619(Pseudomonas putida W619)的5182个基因，马红球菌103S(Rhodococcus equi103S)的4512个基因，红平红球菌PR4(Rhodococcuserythropolis PR4)的6030个基因，枯草芽孢杆菌BSn5(Bacillus subtilis BSn5)的4145个基因，枯草芽孢杆菌subsp. spizizenii TU-B-10(Bacillus subtilis subsp.spizizenii TU-B-10)的4297个基因，枯草芽孢杆菌subsp. spizizenii str. W23(Bacillussubtilis subsp. spizizenii str. W23)的4062个基因，枯草芽孢杆菌subsp. subtilisRO-NN-1(Bacillus subtilis subsp. subtilis RO-NN-1)的4101个基因，枯草芽孢杆菌subsp. subtilis str.168(Bacillus subtilis subsp. subtilis str.168)的4176个基因，根瘤菌USDA110(Bradyrhizobium japonicum USDA110)的8317个基因作为原始的分析数据，取自NCBI(美国国立生物技术信息中心)。使用密码子分析软件对腈类降解微生物的最优密码子和同义密码子使用频率进行了分析和统计计算，结果显示所有的腈类降解微生物存在密码子偏好性。在任一个被分析的腈类微生物中，仅仅只有少数的密码子不存在最优密码子，大部分的氨基酸存在最优密码子。基于同义密码子相对使用频率的对应分析显示轴1和轴2是两个主要的因素决定同义密码子的使用变化。