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目的了解广西结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis,MTB）异烟肼（isoniazid,INH）耐药流行特征,探讨INH耐药的影响因素;了解结核分枝杆菌INH耐药基因突变特征、谱系分布及基因型构成,为广西耐INH结核病（Tuberculosis,TB）防控措施的制定提供理论依据,同时为今后的分子流行病学、耐药机制等研究奠定基础。方法采用监测的方法,结合各地工作基础,以桂林、贵港、百色、崇左和防城港5个市为研究现场,采用单纯随机抽样法抽取5个市中的21个县（市、区）。连续纳入2017年1月～12月在各监测点当地结核病防治机构登记治疗的符合病例纳入标准、问卷信息完整且培养阳性的MTB菌株共1479株,使用世界卫生组织推荐的比例法对INH进行耐药性检测,采用随机数字表法分别从INH耐药和敏感菌株中抽取101株和516株,提取菌株DNA进行全基因组测序,将测序结果与NCBI数据库中的标准菌株H37Rv序列进行比对,使用python 2.7对原始数据进行处理,通过Blast进行序列比对提取出43个间隔序列,利用MEGA 7构建系统发育树后在i TOL网站进行修饰。使用Epidata 3.1对问卷进行双录入并核对,采用SPSS 22.0进行统计分析,计量资料的比较采用t检验、F分析或秩和检验,分类资料的比较采用卡方检验或Fisher确切概率法,运用非条件Logistic回归模型分析性别、年龄等13个因素对INH耐药的影响。结果1.广西结核分枝杆菌异烟肼耐药流行特征分析:1479株MTB菌株中,桂林市397株（26.84%）、贵港市401株（27.11%）、百色市231株（15.62%）、崇左市316株（21.37%）、防城港市134株（9.06%）。经药物敏感性试验（drug susceptibility testing,DST）确定为INH耐药的有129株,总的INH耐药检出率为8.72%（129/1479）,初治与复治患者INH耐药检出率分别为7.25%（94/1296）和19.14%（35/183）。各季节INH耐药检出率无统计学差异（χ~2=3.063,P=0.382）,人群分布以中青年男性为主,农民所占比例最高（84.50%）,边境地区（百色、崇左、防城港市）INH耐药检出率（10.72%）高于非边境地区（桂林、贵港市）（7.02%）,差异有统计学意义（χ~2=6.325,P=0.012）。2.异烟肼耐药影响因素分析:单因素分析显示,除地区、民族、登记分类、病变累及肺野数（个）与INH耐药的发生有统计学关联（P0.05）。多因素分析显示,地区、登记分类和病变累及肺野数（个）3个因素与INH耐药的发生有统计学关联（P3个的患者均是INH耐药发生的危险因素,其OR值分别为1.49（95%CI:1.03～2.16）、2.65（95%CI:1.72～4.08）和1.56（95%CI:1.06～2.31）。比较边境与非边境地区INH耐药情况及耐药影响因素,发现仅民族和HIV感染状况在两地区的分布有统计学差异（P<0.05）,复治均为两地区INH耐药的危险因素。3.广西结核分枝杆菌异烟肼耐药基因突变特征及谱系分析:在101株耐INH的MTB菌株中,存在INH耐药基因突变的有85株,即DST与耐药性预测结果一致率为84.16%（85/101）,共发现的INH耐药突变基因有4种,包括kat G、ahp C＿promoter、fab G1＿promoter和inh A基因,其中kat G基因的突变率最高,为90.59%（77/85）,主要为315位点的突变,kat G 315位点突变率为84.71%（72/85）;516株INH敏感的MTB菌株中,存在INH耐药基因突变的有35株（6.78%,35/516）,共发现的INH耐药突变基因有5种,包括kat G、kas A、fab G1＿promoter、ahp C＿promoter和inh A基因,其中kat G基因的突变率最高,为51.43%（18/35）,主要为315位点的突变,kat G 315位点突变率为40.00%（14/35）。kat G 315位点突变在INH耐药和敏感菌株中的分布差异有统计学意义（χ~2=331.117,P<0.001）,将传统DST设为金标准,检测kat G 315位点突变的灵敏度为71.29%,特异度为97.29%,阳性预测值为83.72%,阴性预测值为94.54%,约登指数为0.69,Kappa值为0.73,绘制受试者工作特征曲线（receiver operating characteristic curve,ROC）,发现ROC曲线下的面积为0.84,对曲线下面积进行检验,结果显示有统计学意义（P3个是INH耐药的危险因素,应重点关注该类患者;复治均为广西边境和非边境地区INH耐药的危险因素,两地应重点关注该类患者;在所有发现的INH耐药突变基因中,以kat G基因突变率最高,特别是315位点的突变;kat G 315位点突变预测INH易感性的灵敏度为71.29%,特异度为97.29%,可考虑将检测此位点突变作为广西INH耐药筛查、诊断及排除的辅助手段,这对INH耐药结核病的防控具有重要指导价值;结核分枝杆菌INH耐药菌株主要由L2构成,北京基因型为主要流行菌株;在发生kat G基因突变的菌株中,以L2所占比例最大,应重点关注该类菌株。