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毕氏肠微孢子虫作为一种人畜共患性的机会性致病体,目前尚无安全有效的防治手段,其流行机制也知之甚少。我国恒河猴种群数量众多,其栖息地环境复杂多样,分析不同生活条件下的恒河猴毕氏肠微孢子虫感染情况,不仅可以了解其健康状态,从而进行及时的疫病防控,还可为深入研究毕氏肠微孢子虫的感染流行机制提供一定的基础数据。然而目前国内有关恒河猴毕氏肠微孢子虫感染情况的报道较少,已被调查了解的恒河猴种群数量也较少,且范围较窄,难以对其流行机制做出有效的分析。本研究在我国的11个圈养恒河猴种群、7个野生、3个半野生种群中共采集了522个粪便样品,以核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列为分子标记,进行了毕氏肠微孢子虫的流行情况调查、基因分型和人畜共患性分析,主要结果如下:(1)21个恒河猴种群中,17个种群检测出毕氏肠微孢子虫的存在,种群内平均感染率为12.5%,表明我国恒河猴种群中毕氏肠微孢子虫的流行较为普遍。17个恒河猴种群中个体感染率最高可达56.5%,但大都处于4%-17%之间。比较不同种群的感染差异发现,恒河猴的毕氏肠微孢子虫感染率可能与该种群和潜在传播源的接触程度相关,良好的饲养管理与卫生标准能有效降低毕氏肠微孢子虫的感染率。(2)ITS序列分型发现共检测到17个基因型,其中13个为本研究首次发现的新基因型(命名为Mul1-Mul13),4个(D、CM1、EbpC、SCC2)为已报道的基因型。已知基因型中,D、EbpC已被证实具有人畜共患能力,CM1与SCC2目前尚未在人类感染中发现。另外,本研究首次发现SCC2在恒河猴中也有感染。(3)17个被感染恒河猴种群中,毕氏肠微孢子虫基因型D在13个种群中发现,而基因型CM1只在圈养恒河猴中发现,基因型EbpC则只在野生和半野生恒河猴中发现,其它基因型则只出现在个别种群中,表明不同环境下恒河猴毕氏肠微孢子虫的感染类型存在一定的特异性,但基因型D在我国恒河猴中分布较普遍。(4)系统发生关系显示13个新发现基因型中有11个与具有人畜共患能力的D、EbpC等基因型聚为一支(Group1),表明这些基因型可能具有潜在的人畜共患能力。同时也表明,恒河猴是人畜共患性毕氏肠微孢子虫的重要携带者,可能造成一定的公共卫生隐患。