从区域创新资源整合的角度出发,在总结国内外对创新资源整合相关研究的基础上,通过对系统的基本理论、资源配置效率理论、新制度经济学理论等的相关研究,总结出区域创新资源整合的实现机制由市场机制、政府机制和社会机制三大机制构成,并且要求三大机制相互协调、相互制约从而使区域创新资源得到高效整合。通过对甘肃省区域创新资源存量及其整合的现状调查,从实证角度出发,对甘肃省创新资源整合的现状进行分析,揭示了甘肃省创新资源整合低效的根本原因:创新资源高效整合系统仍未建立,资源整合的制度、体制和机制保障缺失。在此基础上,提出了甘肃省创新资源整合的实现机制主要有整合的核心机制、保障机制和补充机制三大机制构成,并且,这三大机制必须同时存在,共同发挥作用,才能切实保证创新资源整合体系的良好运行,真正实现甘肃创新资源的高效配置。最后为构建甘肃省区域创新资源高效整合系统提供了相应的政策建议。