观赏海棠主要指蔷薇科(Rosaceae)苹果属(Malus Mill)中果实直径小于5cm,且具有观赏价值(花、叶、果等)的植物的统称,广泛分布于北半球温带地区。目前,观赏海棠新品种主要从自由授粉子代中选育而来。由于自由授粉的随机性,产生观赏价值优良子代的比例低,而性状的定向选育及提高育种效率必须建立在人工控制杂交的基础上。因此,人工控制杂交之前,需要对主要性状在世代间遗传规律、不同杂交组合的遗传效应等有清楚的认识,仅仅依靠现有的半同胞家系材料,难以获得足够的信息。因此,本研究以江苏省江都区国家海棠种质基因库中的10个母本观赏海棠品种及其半同胞家系、92个候选父本观赏海棠品种为材料。通过对主要性状的调查,利用SSR分子标记技术对10个半同胞家系进行父本分析甄别父本,结合表型性状数据对亲子代之间的性状遗传进行分析,并为今后观赏海棠的人工控制杂交育种提供依据。(1)在观赏海棠的花色、花型、叶色、果色以及树姿5观赏性状中,除花型外,其他4个性状在研究的亲本和子代中均呈现出较高的多样性。其中,亲本性状的平均Shannon多样性指数为0.76,5个半同胞家系多样性指数的高低在0.65与0.51之间。(2)利用来自苹果EST序列开发筛选出13对SSR分子标记分析了亲本和子代的遗传多样性。从所有样本水平上来看,观赏海棠的Nei遗传多样性指数(H)平均为0.678,Shannon多样性指数(Ⅰ)平均为1.313,具有较丰富的遗传多样性。其中亲本群体的Nei遗传多样性指数(H)为0.709,Shannon多样性指数(Ⅰ)为1.387;10个半同胞家系群体的Nei遗传多样性指数(H)在0.396-0.508之间,平均为0.446;Shannon多样性指数(Ⅰ)在0.710-0.918之间,平均为0.804。亲本及家系的SSR多样性与表型多样性基本一致,而不同家系表现为不同的变异水平。(3)利用13对多态性高的SSR引物对观赏海棠自由授粉子代进行的父本分析,在95%的置信水平上可以为184株个体中的73株确定唯一的父本,父本确定率为39.13%,这些父本来自于42个观赏海棠品种,其中父本‘盛花’品种的繁殖贡献率最高为3.8%,产生了7株后代。而在80%的置信水平上父本确定率为84.97%,贡献最多的父本有12个子代。基于父本分析分结果的亲子代性状遗传分析表明,尽管子代性状多数与父母本相似,一些偏向于母本,一些偏向于父本,但有些杂交组合能产生新变异的后代,尤其以‘大卫’、‘芭蕾舞’等作为为父本,在子代中会出现较高频率的变异。我们可通过这些杂交组合人工杂交,有望在子代中获得更多有观赏价值的变异类型。