猪NCK家族基因的克隆、染色体定位及组织表达谱

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jingcang_wu
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接头蛋白NCK家族包括两个成员NCK1(NCKα,NCK)和NCK2(NCKβ,Grb4),该家族两个成员的共同结构都包括N末端的3个SH3结构域和C末端的1个SH2结构域。它们被认为与各种细胞活动、连接受体和肌动蛋白的信号途径相关,如细胞形态学和细胞骨架重排。  本研究采用PCR的方法,通过猪的EST序列,克隆了猪这两个基因的CDS序列;采用辐射杂种细胞系(RH)技术对它们进行了染色体定位;采用RT-PCR的技术,以猪和小鼠不同组织样品的cDNA为模板,对猪和小鼠NCK的组织表达谱进行了分析。  研究结果表明:猪NCK1基因的编码区有1134个核苷酸,编码377个氨基酸。它的氨基酸序列与人、小鼠、大鼠、牛和狗分别享有97.3%、97.3%、97.1%、97.9%和98。1%的同源性;NCK2基因的编码区有1131个核苷酸,编码376个氨基酸。它的氨基酸序列与人、小鼠、大鼠、牛和狗的同源性分别为90.3%、88.4%、88.4%、96.3%和90.5%。  NCK1基因定位于猪13q23-q24带和13q32带之间,与标记SW2412和SWC22紧密连锁;NCK2基因定位于猪3p11-p12(SW1618)和3q11-12(SW2597)之间,与标记SWR2069紧密连锁。其结果与人猪比较图谱相对应,进一步证实了人3号与猪13号染色体、人2号与猪3号染色体之间的对应关系。  组织表达谱的结果分析表明,NCK2基因在猪的11种组织中部分表达,其中在肺、脾和睾丸中检测到高表达,其次是肠、胃、肾、肝、脂肪和大脑,而在心和肌肉中几乎不表达。而NCK2基因的剪接体则在肝中超高表达,远高于其它组织。  在小鼠的11种组织中,NCK1基因和NCK2基因均广谱表达,而表达量各有差异,其中在NCK1基因肺和睾丸中检测到高表达,其次是脾和脂肪,而在其它几种组织中表达量较少;而NCK2基因在睾丸、脂肪和肺中检测到高表达,其次是大脑、肾和脾,而在其它几种组织中表达量较少。
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