南大2419是我国小麦育种中一个重要的骨干亲本,具有优异的农艺性状及配合力,先后被用于130个衍生品种的培育。为了分析南大2419型等位变异在衍生品种中的贡献,本研究利用90k iSelect SNP芯片对南大2419衍生系中一代到四代品种进行全基因组扫描;并以3B染色体上829个标记为例,对我国125份小麦微核心种质群体进行农艺性状的关联分析,明确了南大2419基因型的遗传效应。此外本研究还对南大2419与望水白重组自交系中定位于5A染色体上控制分蘖数的主效QTL QSn.nau-5A进行了验证,结果如下:1、通过对125份微核心种质群体进行全基因组关联分析,在3B染色体上共检测到74个与旗叶宽、粒重、株高、开花期显著相关的SNPs,其中一些表现为一因多效,大多数SNPs位点上南大2419型等位变异的农艺性状表现优异。2、通过对南大2419各世代衍生品种进行全基因组扫描,发现在3B染色体上有306个南大2419型等位变异在各个世代品种中的频率显著高于微核心种质中该型等位变异的频率(P=O.O01),此外,3B染色体上也存在88个南大2419型等位变异在各个世代品种中频率显著低于微核心种质中该型等位变异频率的SNPs(P=0.001),南大2419型等位变异被正向选择的SNPs数目是负向选择的3.5倍。3、与农艺性状相关的74个SNPs在衍生系品种中的传递情况大致可分为三类。第一类:南大2419型等位变异农艺性状表现优异,在各世代中相对频率具有增加的趋势,这种类型有60个;第二类:南大2419型等位变异是非优异等位变异,在各世代中相对频率逐渐降低,这种类型有6个;第三类SNPs共8个,其南大2419型等位变异具有有利的农艺表现,但其在衍生系后代中相对频率没有显著变化。这一结果进一步说明南大2419等位变异多数表现优异。4、755个与农艺性状不相关的SNPs位点上南大2419型等位变异在衍生系品种中的传递情况也可大致分为以上三类,其中77.5%的位点上南大2419型等位变异在后代中频率没有显著变化;14.3%的SNP位点上南大2419型等位变异在后代中相对频率显著增加;8.2%的SNP位点上南大2419型等位变异显著降低(P=0.001)。5、将南大2419与望水白重组自交系中定位的控制分蘖数的主效QTL QSn.nau-5A分别导入郑麦9023和扬麦17中,构建了二个近等基因系。与轮回亲本相比,其相应近等基因系的分蘖数分别增加3.75个和2.9个。为了更精确定位该QTL,还进行了 QTL区间的重组体筛选,目前已经获得7种以郑麦9023为背景的纯合重组体和14种以扬麦17为背景的纯合重组体。