随着海洋战略地位的日益凸显,海洋事务面临着新形势的挑战,各沿海国家都先后调整或建立起本国特色的海洋管理体制。在当下中国的海洋管理体制中,沿海的地方政府具体承担着相当部分的海洋管理职能。但众所周知,海洋是一个流动的水体,具有跨地区性的特点,因此需要政府在这一跨地区性公共事务中合作共治,而这就必须依赖与地方政府间关系特别是没有行政隶属关系的地方政府间关系即横向关系的协调发展,但是由于相关制度供给不足,使得地方政府间关系也出现了种种问题,影响了对海洋进行科学有效的管理,亟需加以治理。因此,对地方政府间横向关系协调进行理论研究,以提高其治理绩效,不仅有实践价值也具有理论意义。本文运用公共管理基础理论和新制度经济学的理论,通过比较研究、案例分析、文献研究等,对我国海洋管理中地方政府间横向关系发展中出现的问题、治理思路、现有机制的治理绩效、新型治理之道进行了经验研究基础上的规范研究。本文的研究表明:有效和系统的制度设计是提高政府间横向关系绩效的必由之路;现行治理机制虽然能解决一部分问题,但由于其内在的缺陷而并没有实现预期目标;组织间网络作为一种新型的治理机制,具有相对的治理优势;实践表明,必须综合运用多种治理机制,良好的制度环境和规范的地方政府管理同时不可或缺。因此本文的结论是:当代中国区域海洋综合管理中的地方政府间横向关系协调应该综合运用多种治理机制,根据不同条件选择不同的治理机制。而最终要提高治理绩效,还需要构建良好的制度环境和规范地方政府管理。