柑橘黄龙病病原代谢相关酶(FabZ)蛋白表达纯化与晶体学研究

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柑橘黄龙病是由革兰氏阴性细菌韧皮部杆菌引起的、由柑橘木虱为主要虫媒传播的病害,这种病害可导致柑橘类果实出现黄化症状,并且使果实形状出现畸形、颜色改变,从而严重影响柑橘产量。目前针对柑橘黄龙病还没有有效的防治措施。近些年来,病原微生物导致的传染病爆发,使得抗菌药物的研究变得极为迫切。脂肪酸生物合成在细胞中起着非常重要的作用。一般来说,根据参与脂肪酸生物合成(FAS)的酶的结构的不同,脂肪酸生物合成途径被分为两大类,其一是存在于哺乳动物与真菌体内的Ⅰ型脂肪酸生物合成途径,参与合成反应的酶的活性位点存在于一个多功能复合体上,另一种是存在于细菌与植物叶绿体内的Ⅱ型脂肪酸生物合成途径,每一步合成反应都是由一个单独的酶催化,且这些酶是由酰基链共价连接到酰基载体蛋白上,并且这些酶在不同种属的细菌中是完全不一样的。β-羟脂酰-ACP脱水酶(FabZ)催化Ⅱ型脂肪酸合成途径中的重要一步,它催化β-羟脂酰-ACP脱水生成反-2-烯酰-ACP,如果β-羟脂酰-ACP脱水酶被抑制,细菌的生长和繁殖过程中的重要生物合成途径都将会受到阻断,使细菌无法生长。由此可以看出,β-羟脂酰-ACP脱水酶可以作为开发与设计新型抗菌药物的非常有用的靶标。本课题通过基因克隆和蛋白质表达、纯化的研究,我们得到了较纯的ClFabZ蛋白,其单体的分子量约为18KD,通过分子排阻色谱分析,得知ClFabZ蛋白在溶液中是以六聚体的形式存在的。利用坐滴式气液扩散法,通过采用美国Hampton Research公司的晶体筛选试剂盒进行初筛,我们初步得到了ClFabZ的结晶条件,并对该条件进行优化,得到ClFabZ蛋白的最适结晶条件为PEG/Ion2:32(2%v/v Tacsimate pH5.0,0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH5.6,16%w/v Polyethylene glycol3350),蛋白质浓度为7mg/mL,最适生长温度为20℃。晶体数据的获得是通过在上述相同条件下培养的硒代ClFabZ蛋白得到的晶体,将晶体在上海同步辐射光源收集X-射线衍射数据,分辨率可达2.9A。然后对得到的晶体数据使用PHENIX软件进行分析,得出ClFabZ晶体属于P6122空间群,晶胞参数为a=b=75.346,c=353.236,α=β=90,γ=120。根据氨基酸序列比对分析发现,ClFabZ的二聚体结构与其它已知的FabZ结构相似,每个单体的结构都有一个典型的β+α"hot dog"折叠。每个亚基中包含了8个高度弯曲的反向平行的β折叠,它们围绕着一个中心的α螺旋,并且有两个短的α螺旋位于N端,一个位于N端的起始位置,另一个位于β2与α3之间。通过ClFabZ同源结构活性位点的比对分析,可预测ClFabZ的催化活性位点可能位于亚基与亚基之间的接触面所形成的通道中,每个接触面包埋着2个活性位点,由同源结构分析提出可能的催化活性位点是二聚体一个亚基上的His57和另一个亚基上的Glu71,催化活性位点位于通道的中间部位。C1FabZ晶体结构的获得,不但能够提供FabZ的空间结构数据,而且能为以FabZ为靶标的抑制剂的设计与筛选提供基础,并且为FabZ的催化机制研究提供重要的理论依据。
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