创新霉素与色氨酰-tRNA合成酶复合物的结构研究

来源 :华北理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:spcheng
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的高效表达嗜热脂肪芽胞杆菌色氨酰-tRNA合成酶(BsTrpRS),获得创新霉素与BsTrpRS的复合物晶体,并利用X-ray进行晶体衍射数据收集和晶体结构程序解析复合物的晶体结构,结合分子动力学模拟从分子水平揭示药物与受体相互作用的机制,为药物的设计与优化提供理论基础。方法1.构建含有BsTrpRS蛋白目的基因的表达载体,利用大肠杆菌表达系统获得TrpRS蛋白的可溶性表达。2.采用亲和层析色谱、离子交换色谱和分子排阻色谱纯化目的蛋白,以期获得纯度在90%以上的BsTrpRS,后通过表面等离子共振法(SPR)和等温滴定量热法(ITC)来检测BsTrpRS的活性。3.选用气相扩散悬滴法,通过优化结晶条件(包括蛋白浓度、沉淀剂浓度、温度和pH等)获得可进行X-ray衍射的高质量晶体,获取衍射数据。4.采用共结晶法获取BsTrpRS与创新霉素复合物的晶体。5.将得到的复合物晶体进行X-ray衍射并收集数据,解析复合物晶体结构,并结合分子动力学模拟和定点突变验证,揭示创新霉素在BsTrpRS靶点的作用机制。结果1.运用分子生物学方法成功构建含BsTrpRS基因的重组质粒,并通过优化得到BsTrpRS蛋白高表达菌株BL21(DE3)。2.运用亲和层析、离子交换色谱和分子排阻色谱等蛋白纯化下游技术,获得高纯度BsTrpRS蛋白。3.通过SPR和ITC技术,验证了BsTrpRS的活性,并确证了创新霉素与BsTrpRS之间具有高亲和力。4.通过晶体筛选,获得了X-ray衍射分辨率为2.06?的创新霉素*BsTrpRS二元复合物晶体和2.16?的创新霉素*ATP*BsTrpRS三元复合物晶体,并解析得到各自的复合物三维结构,结合分子动力学模拟和定点突变验证,从分子水平揭示了创新霉素与BsTrpRS之间的相互作用机制。结论本研究从分子水平阐明了创新霉素与其靶点BsTrpRS相互作用的机制,为创新霉素与BsTrpRS的结合提供了确切的分子结构模型,为后期筛选、设计药效更好的创新霉素药物打下理论基础。图34幅;表13个;参111篇。
其他文献
硫代葡萄糖苷(简称硫苷)是十字花科植物中富含氮、硫的次生代谢产物,在植物防御方面具有重要作用。本文研究甜菜夜蛾取食(生物胁迫)、机械损伤(非生物胁迫)和MeJA对甘蓝中硫苷含量的影响,以及结合硫苷合成、二次修饰和转运,得到甘蓝中硫苷对虫害的响应。以上胁迫都会释放细胞中的ATP,其作为一个重要早期危险信号,可以诱导植物的抗性增强,很可能通过下游JA/ET途径间接调节硫苷。主要研究结果如下:1.一定程
目的:观察锌指蛋白A20在内毒素(lipopolysaccharide,LPS)刺激情况下,对人椎间盘髓核细胞炎症因子、核因子-kappB(NF-κB)以及细胞退变指标表达变化的影响。方法:获取2017年6月至2018年7月间于我院骨科腰椎间盘退变患者术中切除的椎间盘组织,提取原代髓核细胞并进行培养,选择P1、P2代髓核细胞进行实验。采用完全随机法将同来源同代培养的髓核细胞分为对照组、单纯过表达A
目的:研究半鼻中隔粘膜瓣经蝶入路在内镜经蝶垂体瘤切除术中的运用方法:回顾性分析2016年至2018年在江西省人民医院神经外科接受内镜半鼻中隔粘膜瓣经蝶入路手术的62例垂体瘤患者临床资料结果:62例患者中,55名(88.71%)患者肿瘤无残留或复发,肿瘤残留4例,3例复发。脑脊液漏者总共5例(8.06%),术中鞍隔破裂3例(4.84%),术后迟发性脑脊液漏2例(2例患者均有长期未控制的咳嗽病史),手
里耶秦简出土于湖南省湘西自治州龙山县里耶镇里耶古城遗址一号井(J1)内。出土简牍38000余枚,其中有字简17000余枚,是21世纪以来出土数量最多的一批简牍,也是迄今出土秦简牍
近些年来,间断有限元方法在流体计算领域得到了广泛的应用。然而,在高阶微分方程中直接应用DG方法是困难的。为了更好的解决问题,随后,将DG方法进行延伸得到了LDG方法,此方法
令q为一个素数方幂,Fq为一个q元有限域.如果多项式f(x)∈Fq[x]对应的映射是一个Fq到其自身的一个双射,则称f(x)是Fq上的置换多项式.有限域上的置换多项式在密码学,编码学,组
赤眼鳟(Spualiobarbus Curriculus)属鲤科(Cyprinidae)、赤眼鳟属,是一种重要的广温性淡水经济鱼类,生活在水体中上层,繁殖季节一般在5~8月份。近年来的生产实践发现赤眼鳟夏
自被发现以来,由于对虾白斑综合症病毒(WSSV)的高传染性,高死亡率,此病毒成为了危害虾类养殖业的主要病原之一,并严重影响了对虾产业的发展。由于WSSV感染宿主的关键步骤之一
储层物性研究是煤层气勘探开发的重要组成部分,煤岩学控制机理是煤层气开发地质中的关键科学问题。为精细描述韩城煤层气勘探开发示范区煤储层物性并研究其煤岩学控制机理,本
研究背景与目的:阿霉素(Doxorubicin,Dox)是使用最广泛的蒽环类抗肿瘤药物,疗效显著,但因具有严重心脏毒性,临床应用受限。长期以来,阿霉素心脏毒性研究甚多,具体哪一种机制起主导作用尚未明确。阿霉素作用于心肌组织最严重的后果是导致正常心肌组织的凋亡和坏死,最终心肌细胞被纤维组织取代,形成以肌成纤维细胞增多为特点的心肌纤维化。心肌纤维化是心肌重构的主要内容。内皮间质转化(Endotheli