公司治理结构，是一种对公司进行管理和控制的体系，是指由所有者、董事会、高级经理人员和监事会组成的一种组织结构。随着对公司治理结构研究的不断深入，本文对公司治理结构的研究已经不再是单纯的从表面对公司治理要素的研究，而是深入研究对公司治理结构有影响的根源，即改制模式对公司治理结构的影响。从这一新的角度出发，发现公司治理结构深层次的制度因素。本文以我国2003-2007年沪深两市A股150家国有企业首次公开发行后三年的数据为研究样本,以逻辑回归和线性回归为实证分析方法，主要从股权结构、董事会特征和管理层特征三个方面分析不同改制模式下公司治理结构的比较。本文通过实证研究得出结论发现，在股权结构方面非完整改制公司的第一大股东持股比例高于完整改制公司，同时非完整改制公司的国有股持股比例要高于完整改制公司。其次，在董事会特征方面，我们实证得出非完整改制公司的董事会规模比完整改制公司的大；非完整改制公司的董事会活动强度（董事会会议次数）要低于完整改制公司；非完整改制公司的董事会激励强度弱于完整改制公司。最后，在管理层特征方面，我们实证得出的结论是在董事长兼任控股股东时，非完整改制公司和完整改制公司的董事会两职状态不存在显著区别；非完整改制公司和完整改制公司的管理层持股比例不存在显著区别；非完整改制公司的管理层薪酬总和要高于完整改制公司。改制模式是影响公司治理结构的主要因素，很大程度上，公司治理结构上存在的很多问题是由于国有企业改制不彻底造成的。本文在公司治理结构的研究结论进一步推进了国有企业改制上市方面的研究，并为监管层如何推进国有企业上市提供了理论依据。