【摘 要】
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随着信息技术在新药创制中的不断成功应用,以多样性分析为基础的计算机药物虚拟筛选成为当前新药研究中克服化合物数目不足对新药创制的制约的重要技术手段,基于结构的分子对
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随着信息技术在新药创制中的不断成功应用,以多样性分析为基础的计算机药物虚拟筛选成为当前新药研究中克服化合物数目不足对新药创制的制约的重要技术手段,基于结构的分子对接技术(Dock)是目前公认最有效的虚拟筛选技术,决定虚拟筛选结果准确性的因素主要有两方面:对配体与受体相互作用模拟的仿真程度和对相互作用结果的定量评价技术。发展基于药效团的评分技术(PocketV.2),是当前对分子对接结果的定量评价技术的重要补充和提高,可以提高基于分子对接技术的虚拟筛选的准确性。本文从有机化合物分子三维空间结构出发,提出并建立表示分子空间结构的三维距离矩阵计算模型,并基于三维距离矩阵提出模拟配体与受体真实相互作用的距离及性质的点模式匹配算法,完成了PocketV.2与Dock的整合,实现整合药效团评分方法的分子对接,提高虚拟筛选的可靠性,从而有望进一步提高新药研究的效率,推动药物分子设计技术的发展。
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