牛基因组中rWAP基因部分同源序列的克隆与分析

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PCR扩增牛基因组DNA,得到的产物序列1(240bp)比rWAP的对应段(204bp)长近40bp,序列2(183bp)比rWAP的对应片段(161bp)长22bp,这种现象可能与祖先基因的基因组重排、染色体混编、基因间或基因内的重复<[48]>或内含子的去除<[51]>等进化有关.序列1具有CCTGGAAGGTGTT(107bp~120bp),CAGGTGGTTCTCG(125bp~138bp),CTGCTCTAGTGTTCCAGGG(213bp~232bp)三个转糖苷酶的一个CATGCGCTGTCCTC(4bp~18bp)碱性磷酸样酶基序(motif)序列,并与兔、猪、骆驼对应序列同源性分别为55.4﹪、45.1﹪、46.7﹪,与牛α-干扰素mRNA碱基同源性为61.963﹪,而猪与兔、骆驼对应序列同源性分别为54.9﹪、79.6﹪,兔与骆驼对应序列同源性分别为61.7﹪.序列2具有GGTGAGTGCCCATGGGCCAGGCCGGA(14bp~40bp)柠檬酸合成酶(Citrate synthase)基序(motif)样序列.氨基酸同源性比较结果表明牛基因组中有WAP结构域样的WAP样蛋白(Trappin-2),该试验结果得到的牛基因组中“WAP样”序列(序列1、序列2)与转糖苷酶(Transglycosidases)、碱性磷酸样酶(Alkaline phosphatase-like)和柠檬酸合成酶(Citrate synthase)基序(motif)序列进化有关,可能也与牛α-干扰素(alph-interferon)进化有关.
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